J 2011

High resolution positioning of intron ends on the nucleosomes

HAPALA, Jan a Eduard TRIFONOV

Základní údaje

Originální název

High resolution positioning of intron ends on the nucleosomes

Autoři

HAPALA, Jan (203 Česká republika, domácí) a Eduard TRIFONOV (376 Izrael, garant, domácí)

Vydání

Gene, Elsevier, 2011, 0378-1119

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Nizozemské království

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.341

Kód RIV

RIV/00216224:14740/11:00054899

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

UT WoS

000296415900002

Klíčová slova anglicky

AG-ends of introns; Gene splicing; GT-ends of introns; Nucleosome mapping; Protection of splice junctions; Rotational positioning

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 13. 4. 2012 08:52, Olga Křížová

Anotace

V originále

High resolution sequence-directed nucleosome mapping is applied to 36,000 sequences containing splice junctions, from five different species.Moreover, the orientation of guanine residues at the GT- and AG-ends of introns within the nucleosomes is such that the guanines are positioned nearest to the surface of histone octamers, 3 and 4 bases upstream from the local DNA pseudo-dyads passing through minor grooves oriented outwards. Since the guanine residues are the most vulnerable to spontaneous damage within the cell (primarily, depurination and oxidation) such positioning of the splice junctions minimizes the damage that is caused by free radicals and highly reactive metabolites.

Návaznosti

MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
SIGA 792, interní kód MU
Název: CHROMPLANT
Investor: Jihomoravský kraj, CHROMPLANT, Granty pro zahraniční vědce