J 2011

"Anticipated" nucleosome positioning pattern in prokaryotes

RAPOPORT, Alexandra E. a Eduard TRIFONOV

Základní údaje

Originální název

"Anticipated" nucleosome positioning pattern in prokaryotes

Autoři

RAPOPORT, Alexandra E. (376 Izrael) a Eduard TRIFONOV (376 Izrael, garant, domácí)

Vydání

Gene, Elsevier, 2011, 0378-1119

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Nizozemské království

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.341

Kód RIV

RIV/00216224:14740/11:00054900

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

DOI

UT WoS

000296316400005

Klíčová slova anglicky

Amphipathic alpha helices; Evolution of nucleosome positioning pattern; Hidden sequence patterns; Sequence periodicity; Shannon N-gram extension

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 13. 4. 2012 08:51, Olga Křížová

Anotace

V originále

Linguistic (word count) analysis of prokaryotic genome sequences, by Shannon N-gram extension, reveals that the dominant hidden motifs in A+T rich genomes are T(A)(T)A and G(A)(T)C with uncertain number of repeating A and T. In this case the above patterns in prokaryotes may be considered as "anticipated" nucleosome positioning patterns which, quite likely, existed in prokaryotic genomes before the evolutionary separation between eukaryotes and prokaryotes.

Návaznosti

MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
SIGA 792, interní kód MU
Název: CHROMPLANT
Investor: Jihomoravský kraj, CHROMPLANT, Granty pro zahraniční vědce