Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis
ZEDEK, František and Petr BUREŠ. Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis. PloS ONE. San Francisco: Public Library of Science, 2012, vol. 7, No 1, p. 1-5. ISSN 1932-6203. Available from: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0030496. |
Other formats:
BibTeX
LaTeX
RIS
|
Basic information | |
---|---|
Original name | Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis |
Name in Czech | Přítomnost centromerického tahu u holocentrických chromosomů rodu Caenorhabditis |
Authors | ZEDEK, František (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution) and Petr BUREŠ (203 Czech Republic, belonging to the institution). |
Edition | PloS ONE, San Francisco, Public Library of Science, 2012, 1932-6203. |
Other information | |
---|---|
Original language | English |
Type of outcome | Article in a journal |
Field of Study | Genetics and molecular biology |
Country of publisher | United States of America |
Confidentiality degree | is not subject to a state or trade secret |
WWW | URL |
Impact factor | Impact factor: 3.730 |
RIV identification code | RIV/00216224:14310/12:00057248 |
Organization unit | Faculty of Science |
Doi | http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0030496 |
UT WoS | 000301570600047 |
Keywords (in Czech) | Centromeric drive; holocentric chromosomes; kinetochore proteins; telokinetic meiosis |
Keywords in English | centromerický tah; holocentrické chromosomy; kinetochorové proteiny; telokinetická meiosa |
Tags | AKR, rivok |
Tags | International impact, Reviewed |
Changed by | Changed by: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Changed: 22/4/2013 14:06. |
Abstract |
---|
In monocentric organisms with asymmetric meiosis, the kinetochore proteins, such as CENH3 and CENP-C, evolve adaptively to counterbalance the deleterious effects of centromere drive, which is caused by the expansion of centromeric satellite repeats. The selection regimes that act on CENH3 and CENP-C genes have not been analyzed in organisms with holocentric chromosomes, although holocentrism is speculated to have evolved to suppress centromere drive. We tested both CENH3 and CENP-C for positive selection in several species of the holocentric genus Caenorhabditis using the maximum likelihood approach and sliding-window analysis. Although CENP-C did not show any signs of positive selection, positive selection has been detected in the case of CENH3. These results support the hypothesis that centromere drive occurs in Nematoda, at least in the telokinetic meiosis of Caenorhabditis. |
Abstract (in Czech) |
---|
U monocentrických organizmů s asymetrickou meiózou, se kinetochorové proteiny jako např. CENH3 nebo CENP-C, vyvíjejí adaptivně, aby vyvážily škodlivé účinky centromerického tahu, které jsou především následkem zvětšování rozsahu satelitních centromerických repetic.Typ selekce působící na geny kinetochorových proteinů CENH3 a CENP-C nebyl dosud analyzován v organismech s holocentrickými chromozómy, přestože holocentrický typ chromosomů je považován za stav, jehož příčinou vzniku je zabránit centromerickému tahu a tím i jeho potenciálně škodlivým důsledkům. Testovali jsme pozitivní selekci v evoluci genů CENH3 a CENP-C u několika holocentrických druhů rodu Caenorhabditis. I když CENP-C nevykazují žádné známky pozitivní selekce, pozitivní selekce byla zjištěna v případě CENH3. Tyto výsledky podporují hypotézu, že centromerický tah se u holocentrických Nematod dál vyskytuje, minimálně alespoň v případě, že jejich meióza je telokinetická jako v případě Caenorhabditis. |
Links | |
---|---|
GA206/09/1405, research and development project | Name: Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae |
Investor: Czech Science Foundation, Genome size and karyotype evolution in Cyperaceae | |
LC06073, research and development project | Name: Centrum pro výzkum biodiverzity |
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Biodiversity Research Center | |
MSM0021622416, plan (intention) | Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase |
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time |
PrintDisplayed: 18/7/2024 05:41