ZEDEK, František and Petr BUREŠ. Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis. PloS ONE. San Francisco: Public Library of Science, 2012, vol. 7, No 1, p. 1-5. ISSN 1932-6203. Available from: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0030496.
Other formats:   BibTeX LaTeX RIS
Basic information
Original name Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis
Name in Czech Přítomnost centromerického tahu u holocentrických chromosomů rodu Caenorhabditis
Authors ZEDEK, František (203 Czech Republic, guarantor, belonging to the institution) and Petr BUREŠ (203 Czech Republic, belonging to the institution).
Edition PloS ONE, San Francisco, Public Library of Science, 2012, 1932-6203.
Other information
Original language English
Type of outcome Article in a journal
Field of Study Genetics and molecular biology
Country of publisher United States of America
Confidentiality degree is not subject to a state or trade secret
WWW URL
Impact factor Impact factor: 3.730
RIV identification code RIV/00216224:14310/12:00057248
Organization unit Faculty of Science
Doi http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0030496
UT WoS 000301570600047
Keywords (in Czech) Centromeric drive; holocentric chromosomes; kinetochore proteins; telokinetic meiosis
Keywords in English centromerický tah; holocentrické chromosomy; kinetochorové proteiny; telokinetická meiosa
Tags AKR, rivok
Tags International impact, Reviewed
Changed by Changed by: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Changed: 22/4/2013 14:06.
Abstract
In monocentric organisms with asymmetric meiosis, the kinetochore proteins, such as CENH3 and CENP-C, evolve adaptively to counterbalance the deleterious effects of centromere drive, which is caused by the expansion of centromeric satellite repeats. The selection regimes that act on CENH3 and CENP-C genes have not been analyzed in organisms with holocentric chromosomes, although holocentrism is speculated to have evolved to suppress centromere drive. We tested both CENH3 and CENP-C for positive selection in several species of the holocentric genus Caenorhabditis using the maximum likelihood approach and sliding-window analysis. Although CENP-C did not show any signs of positive selection, positive selection has been detected in the case of CENH3. These results support the hypothesis that centromere drive occurs in Nematoda, at least in the telokinetic meiosis of Caenorhabditis.
Abstract (in Czech)
U monocentrických organizmů s asymetrickou meiózou, se kinetochorové proteiny jako např. CENH3 nebo CENP-C, vyvíjejí adaptivně, aby vyvážily škodlivé účinky centromerického tahu, které jsou především následkem zvětšování rozsahu satelitních centromerických repetic.Typ selekce působící na geny kinetochorových proteinů CENH3 a CENP-C nebyl dosud analyzován v organismech s holocentrickými chromozómy, přestože holocentrický typ chromosomů je považován za stav, jehož příčinou vzniku je zabránit centromerickému tahu a tím i jeho potenciálně škodlivým důsledkům. Testovali jsme pozitivní selekci v evoluci genů CENH3 a CENP-C u několika holocentrických druhů rodu Caenorhabditis. I když CENP-C nevykazují žádné známky pozitivní selekce, pozitivní selekce byla zjištěna v případě CENH3. Tyto výsledky podporují hypotézu, že centromerický tah se u holocentrických Nematod dál vyskytuje, minimálně alespoň v případě, že jejich meióza je telokinetická jako v případě Caenorhabditis.
Links
GA206/09/1405, research and development projectName: Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
Investor: Czech Science Foundation, Genome size and karyotype evolution in Cyperaceae
LC06073, research and development projectName: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Biodiversity Research Center
MSM0021622416, plan (intention)Name: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Diversity of Biotic Communities and Populations: Causal Analysis of variation in space and time
PrintDisplayed: 18/7/2024 05:41