ZEDEK, František a Petr BUREŠ. Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis. PloS ONE. San Francisco: Public Library of Science, 2012, roč. 7, č. 1, s. 1-5. ISSN 1932-6203. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0030496.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis
Název česky Přítomnost centromerického tahu u holocentrických chromosomů rodu Caenorhabditis
Autoři ZEDEK, František (203 Česká republika, garant, domácí) a Petr BUREŠ (203 Česká republika, domácí).
Vydání PloS ONE, San Francisco, Public Library of Science, 2012, 1932-6203.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 3.730
Kód RIV RIV/00216224:14310/12:00057248
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0030496
UT WoS 000301570600047
Klíčová slova česky Centromeric drive; holocentric chromosomes; kinetochore proteins; telokinetic meiosis
Klíčová slova anglicky centromerický tah; holocentrické chromosomy; kinetochorové proteiny; telokinetická meiosa
Štítky AKR, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Ing. Andrea Mikešková, učo 137293. Změněno: 22. 4. 2013 14:06.
Anotace
In monocentric organisms with asymmetric meiosis, the kinetochore proteins, such as CENH3 and CENP-C, evolve adaptively to counterbalance the deleterious effects of centromere drive, which is caused by the expansion of centromeric satellite repeats. The selection regimes that act on CENH3 and CENP-C genes have not been analyzed in organisms with holocentric chromosomes, although holocentrism is speculated to have evolved to suppress centromere drive. We tested both CENH3 and CENP-C for positive selection in several species of the holocentric genus Caenorhabditis using the maximum likelihood approach and sliding-window analysis. Although CENP-C did not show any signs of positive selection, positive selection has been detected in the case of CENH3. These results support the hypothesis that centromere drive occurs in Nematoda, at least in the telokinetic meiosis of Caenorhabditis.
Anotace česky
U monocentrických organizmů s asymetrickou meiózou, se kinetochorové proteiny jako např. CENH3 nebo CENP-C, vyvíjejí adaptivně, aby vyvážily škodlivé účinky centromerického tahu, které jsou především následkem zvětšování rozsahu satelitních centromerických repetic.Typ selekce působící na geny kinetochorových proteinů CENH3 a CENP-C nebyl dosud analyzován v organismech s holocentrickými chromozómy, přestože holocentrický typ chromosomů je považován za stav, jehož příčinou vzniku je zabránit centromerickému tahu a tím i jeho potenciálně škodlivým důsledkům. Testovali jsme pozitivní selekci v evoluci genů CENH3 a CENP-C u několika holocentrických druhů rodu Caenorhabditis. I když CENP-C nevykazují žádné známky pozitivní selekce, pozitivní selekce byla zjištěna v případě CENH3. Tyto výsledky podporují hypotézu, že centromerický tah se u holocentrických Nematod dál vyskytuje, minimálně alespoň v případě, že jejich meióza je telokinetická jako v případě Caenorhabditis.
Návaznosti
GA206/09/1405, projekt VaVNázev: Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
Investor: Grantová agentura ČR, Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
LC06073, projekt VaVNázev: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměrNázev: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase
VytisknoutZobrazeno: 29. 7. 2024 03:18