J 2012

Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis

ZEDEK, František a Petr BUREŠ

Základní údaje

Originální název

Evidence for Centromere Drive in the Holocentric Chromosomes of Caenorhabditis

Název česky

Přítomnost centromerického tahu u holocentrických chromosomů rodu Caenorhabditis

Autoři

ZEDEK, František (203 Česká republika, garant, domácí) a Petr BUREŠ (203 Česká republika, domácí)

Vydání

PloS ONE, San Francisco, Public Library of Science, 2012, 1932-6203

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Impakt faktor

Impact factor: 3.730

Kód RIV

RIV/00216224:14310/12:00057248

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000301570600047

Klíčová slova česky

Centromeric drive; holocentric chromosomes; kinetochore proteins; telokinetic meiosis

Klíčová slova anglicky

centromerický tah; holocentrické chromosomy; kinetochorové proteiny; telokinetická meiosa

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 22. 4. 2013 14:06, Ing. Andrea Mikešková

Anotace

V originále

In monocentric organisms with asymmetric meiosis, the kinetochore proteins, such as CENH3 and CENP-C, evolve adaptively to counterbalance the deleterious effects of centromere drive, which is caused by the expansion of centromeric satellite repeats. The selection regimes that act on CENH3 and CENP-C genes have not been analyzed in organisms with holocentric chromosomes, although holocentrism is speculated to have evolved to suppress centromere drive. We tested both CENH3 and CENP-C for positive selection in several species of the holocentric genus Caenorhabditis using the maximum likelihood approach and sliding-window analysis. Although CENP-C did not show any signs of positive selection, positive selection has been detected in the case of CENH3. These results support the hypothesis that centromere drive occurs in Nematoda, at least in the telokinetic meiosis of Caenorhabditis.

Česky

U monocentrických organizmů s asymetrickou meiózou, se kinetochorové proteiny jako např. CENH3 nebo CENP-C, vyvíjejí adaptivně, aby vyvážily škodlivé účinky centromerického tahu, které jsou především následkem zvětšování rozsahu satelitních centromerických repetic.Typ selekce působící na geny kinetochorových proteinů CENH3 a CENP-C nebyl dosud analyzován v organismech s holocentrickými chromozómy, přestože holocentrický typ chromosomů je považován za stav, jehož příčinou vzniku je zabránit centromerickému tahu a tím i jeho potenciálně škodlivým důsledkům. Testovali jsme pozitivní selekci v evoluci genů CENH3 a CENP-C u několika holocentrických druhů rodu Caenorhabditis. I když CENP-C nevykazují žádné známky pozitivní selekce, pozitivní selekce byla zjištěna v případě CENH3. Tyto výsledky podporují hypotézu, že centromerický tah se u holocentrických Nematod dál vyskytuje, minimálně alespoň v případě, že jejich meióza je telokinetická jako v případě Caenorhabditis.

Návaznosti

GA206/09/1405, projekt VaV
Název: Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
Investor: Grantová agentura ČR, Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
LC06073, projekt VaV
Název: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase