Whole Genome Sequences of Three Treponema pallidum ssp. pertenue Strains: Yaws and Syphilis Treponemes Differ in Less than 0.2% of the Genome Sequence

ČEJKOVÁ, Darina, Marie ZOBANÍKOVÁ, Lei CHEN, Petra POSPÍŠILOVÁ, Michal STROUHAL, Xiang QIN, Lenka MIKALOVÁ, Stephen J. NORRIS, Donna M. MUZNY, Richard A. GIBBS, Lucinda L. FULTON, Erica SODERGREN, George M. WEINSTOCK a David ŠMAJS. Whole Genome Sequences of Three Treponema pallidum ssp. pertenue Strains: Yaws and Syphilis Treponemes Differ in Less than 0.2% of the Genome Sequence. PLoS Neglected Tropical Diseases. San Francisco: Public Library of Science, 2012, roč. 6, č. 1, s. "nestrankovano", 14 s. ISSN 1935-2727. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0001471.

Základní údaje

• Originální název: Whole Genome Sequences of Three Treponema pallidum ssp. pertenue Strains: Yaws and Syphilis Treponemes Differ in Less than 0.2% of the Genome Sequence
• Autoři: ČEJKOVÁ, Darina (203 Česká republika, domácí), Marie ZOBANÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Lei CHEN (840 Spojené státy), Petra POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí), Michal STROUHAL (203 Česká republika, domácí), Xiang QIN (840 Spojené státy), Lenka MIKALOVÁ (203 Česká republika, domácí), Stephen J. NORRIS (840 Spojené státy), Donna M. MUZNY (840 Spojené státy), Richard A. GIBBS (840 Spojené státy), Lucinda L. FULTON (840 Spojené státy), Erica SODERGREN (840 Spojené státy), George M. WEINSTOCK (840 Spojené státy) a David ŠMAJS (203 Česká republika, garant, domácí).
• Vydání: PLoS Neglected Tropical Diseases, San Francisco, Public Library of Science, 2012, 1935-2727.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Spojené státy
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• WWW: Art.No. e1471
• Impakt faktor: Impact factor: 4.716 v roce 2011
• Kód RIV: RIV/00216224:14110/12:00081800
• Organizační jednotka: Lékařská fakulta
• Doi: http://dx.doi.org/10.1371/journal.pntd.0001471
• UT WoS: 000300416100021
• Klíčová slova anglicky: Treponema pallidum; Syphilis; Genome; Yaws
• Příznaky: Mezinárodní význam, Recenzováno

Anotace

Spirochete Treponema pallidum ssp. pertenue (TPE) is the causative agent of yaws while strains of Treponema pallidum ssp. pallidum (TPA) cause syphilis. Both yaws and syphilis are distinguished on the basis of epidemiological characteristics and clinical symptoms. Neither treponeme can reproduce outside the host organism, which precludes the use of standard molecular biology techniques used to study cultivable pathogens. In this study, we determined high quality whole genome sequences of TPE strains and compared them to known genetic information for T. pallidum ssp. pallidum strains. The genome structure was identical in all three TPE strains and also between TPA and TPE strains. The TPE genome length ranged between 1,139,330 bp and 1,139,744 bp. The overall sequence identity between TPA and TPE genomes was 99.8%, indicating that the two pathogens are extremely closely related. A set of 34 TPE genes (3.5%) encoded proteins containing six or more amino acid replacements or other major sequence changes. These genes more often belonged to the group of genes with predicted virulence and unknown functions suggesting their involvement in infection differences between yaws and syphilis.

Návaznosti

• GA310/07/0321, projekt VaV: Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum

• MSM0021622415, záměr: Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací