Significant changes between the Xray structure and NMR structure of delta subunit of RNA polymerase

DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana ŠANDEROVÁ, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. Significant changes between the Xray structure and NMR structure of delta subunit of RNA polymerase. In Struktura 2012, Cesko-slovenska krystalograficka spolecnost. 2012. ISSN 1211-5894.

Základní údaje

• Originální název: Significant changes between the Xray structure and NMR structure of delta subunit of RNA polymerase
• Název česky: Podstatni zmeny mezi krystalografickou a NMR strukturou delta podjednotky RNA polymerazy
• Název anglicky: Significant changes between the X-ray structure and NMR structure of delta subunit of RNA polymerase
• Autoři: DEMO, Gabriel (703 Slovensko, domácí), Veronika PAPOUŠKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Hana ŠANDEROVÁ (203 Česká republika), Lukáš ŽÍDEK (203 Česká republika, domácí) a Michaela WIMMEROVÁ (203 Česká republika, garant, domácí).
• Vydání: Struktura 2012, Cesko-slovenska krystalograficka spolecnost, 2012.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14740/12:00057460
• Organizační jednotka: Středoevropský technologický institut
• ISSN: 1211-5894
• Klíčová slova česky: delta podjednotka NMR krystalograficka struktura porovnani
• Klíčová slova anglicky: delta subunit comparism NMR Xray structure

Anotace

RNA polymerase is an essential enzyme. RNAP from gram negative bacteria contain two additional subunits. The delta subunit is 173 aminoacids long and comes from Bacillus subtilis. The N terminal domain displays an ordered structure and the C terminal domain appears to be flexible and unstructured. The N terminal domain was solved either with NMR and Xray. The Xray structure showed completely different behaviour in the region corresponding to beta sheets present in NMR structure. In the Xray structure were found nickel ions which may have a significant effect on the folding of the protein. This is a strong proof that some of the proteins can be differently structured in the solution as in the crystalline phase.

Anotace anglicky

RNA polymerase is an essential enzyme. RNAP from gram negative bacteria contain two additional subunits. The delta subunit is 173 aminoacids long and comes from Bacillus subtilis. The N terminal domain displays an ordered structure and the C terminal domain appears to be flexible and unstructured. The N terminal domain was solved either with NMR and Xray. The Xray structure showed completely different behaviour in the region corresponding to beta sheets present in NMR structure. In the Xray structure were found nickel ions which may have a significant effect on the folding of the protein. This is a strong proof that some of the proteins can be differently structured in the solution as in the crystalline phase.

Návaznosti

• GD301/09/H004, projekt VaV: Název: Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanistických studií k chemoterapii rakoviny

Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanických studií k chemoterapii rakoviny