KUBÍČEK, Karel, Hana ČERNÁ, Peter HOLUB, Josef PASULKA, Dominika HROŠŠOVÁ, Frank LOEHR, Ctirad HOFR, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Richard ŠTEFL. Serine phosphorylation and proline isomerization in RNAP II CTD control recruitment of Nrd1. Genes & Development. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012, roč. 26, č. 17, s. 1891-1896. ISSN 0890-9369. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1101/gad.192781.112.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Serine phosphorylation and proline isomerization in RNAP II CTD control recruitment of Nrd1
Autoři KUBÍČEK, Karel (203 Česká republika, domácí), Hana ČERNÁ (203 Česká republika, domácí), Peter HOLUB (203 Česká republika, domácí), Josef PASULKA (203 Česká republika, domácí), Dominika HROŠŠOVÁ (703 Slovensko, domácí), Frank LOEHR (276 Německo), Ctirad HOFR (203 Česká republika, domácí), Štěpánka VAŇÁČOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Richard ŠTEFL (203 Česká republika, garant, domácí).
Vydání Genes & Development, New York, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012, 0890-9369.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10610 Biophysics
Stát vydavatele Spojené státy
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 12.444
Kód RIV RIV/00216224:14740/12:00057508
Organizační jednotka Středoevropský technologický institut
Doi http://dx.doi.org/10.1101/gad.192781.112
UT WoS 000308391800002
Klíčová slova anglicky RNA polymerase II; CTD code; phosphorylation; proline isomerization; RNA processing and degradation; NMR spectroscopy; structure
Štítky ok, rivok
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnila: Olga Křížová, učo 56639. Změněno: 7. 4. 2013 04:28.
Anotace
Recruitment of appropriate RNA processing factors to the site of transcription is controlled by post-translational modifications of the C-terminal domain (CTD) of RNA polymerase II (RNAP II). Here, we report the solution structure of the Ser5 phosphorylated (pSer5) CTD bound to Nrd1. The structure reveals a direct recognition of pSer5 by Nrd1 that requires the cis conformation of the upstream pSer5–Pro6 peptidyl-prolyl bond of the CTD. Mutations at the complex interface diminish binding affinity and impair processing or degradation of noncoding RNAs. These findings underpin the interplay between covalent and noncovalent changes in the CTD structure that constitute the CTD code.
Návaznosti
ED1.1.00/02.0068, projekt VaVNázev: CEITEC - central european institute of technology
GAP205/12/0550, projekt VaVNázev: Dynamika vzniku shelterinového komplexu
Investor: Grantová agentura ČR, Dynamika vzniku shelterinového komplexu
GAP305/10/1490, projekt VaVNázev: Strukturní podstata ukončení transkripce nezávislé na poly(A) signálu
Investor: Grantová agentura ČR, Strukturní podstata ukončení transkripce nezávislé na poly(A) signálu
GAP305/11/1095, projekt VaVNázev: Funkční a biochemická charakterizace proteinu Dis3L2, třetího lidského homologu hlavní kvasinkové exosomové nukleázy Dis3p
Investor: Grantová agentura ČR, Funkční a biochemická charakterizace proteinu Dis3L2, třetího lidského homologu hlavní kvasinkové exosomové nukleázy Dis3p
GBP305/12/G034, projekt VaVNázev: Centrum biologie RNA
084316/Z/07/Z, interní kód MUNázev: Polyadenylation and mechanisms of nuclear RNA quality control
Investor: Wellcome Trust, Polyadenylation and mechanisms of nuclear RNA quality control
1642, interní kód MUNázev: EMBO Young Investigator Programme (Akronym: EMBO)
Investor: EMBO (European Molecular Biology Organization), EMBO Young Investigator Programme
VytisknoutZobrazeno: 11. 5. 2024 07:52