Výpis publikací

VETEŠNÍKOVÁ ŠIMKOVÁ, Andrea, Kristína KŘÍŽOVÁ, Kristýna VOŘÍŠKOVÁ, Lukáš VETEŠNÍK, Václav HEJRET, Lenka GETTOVÁ, Jiří VOREL, Nikol RESLOVÁ a Vojtěch BYSTRÝ. Heterosis versus breakdown in cyprinid hybrids associated with SVCV infection revealed by transcriptome profile analysis of head kidney. Aquaculture. AMSTERDAM: ELSEVIER, 2024, roč. 578, January, s. "740083", 14 s. ISSN 0044-8486. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.aquaculture.2023.740083.

HEJRET, Václav, Nandan Mysore VARADARAJAN, Eva KLIMENTOVÁ, Katarína GREŠOVÁ, Ilektra-Chara GIASSA, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Panagiotis ALEXIOU. Analysis of chimeric reads characterises the diverse targetome of AGO2-mediated regulation. Scientific Reports. Nature Research, 2023, roč. 13, č. 1, s. 1-9. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-49757-z.

PESCHELOVÁ, Helena, Veronika MANČÍKOVÁ, Lenka DOSTÁLOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Dominika ŠKRNOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. CRISPR/Cas9 technology as a useful tool in the study of chornic lymphocytic leukemia. In CRISPR as a research tool in cancer and regenerative medicine, Stockholm, Švédsko. 2023.

PESCHELOVÁ, Helena, Veronika KOZLOVÁ, Veronika MANČÍKOVÁ, Lenka DOSTÁLOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Dominika ŠKRNOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. CRISPR/Cas9 technology as a useful tool in the study of chronic lymphocytic leukemia. In PhD and PostDoc RETREAT, Sněžné, Milovy. 2023.

MANČÍKOVÁ, Veronika, Michaela PEŠOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Robert HELMA, Kristýna ZÁVACKÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Distinct p53 phosphorylation patterns in chronic lymphocytic leukemia patients are reflected in the activation of circumjacent pathways upon DNA damage. MOLECULAR ONCOLOGY. ENGLAND: WILEY, 2023, roč. 17, č. 1, s. 82-97. ISSN 1574-7891. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/1878-0261.13337.

PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Robert HELMA, Šárka PAVLOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Distinct p53 Phosphorylation Patterns in Chronic Lymphocytic Leukemia: Where They Come from and How They Affect p53 Function. In PhD and PostDoc RETREAT, Sněžné, Milovy. 2023.

SCHUMACHER, Neele, Ilka THOMSEN, Florian BRUNDERT, Václav HEJRET, Stefan DUESTERHOFT, Boris TICHÝ, Dirk SCHMIDT-ARRAS, Matthias VOSS a Stefan ROSE-JOHN. EGFR stimulation enables IL-6 trans-signalling via iRhom2-dependent ADAM17 activation in mammary epithelial cells. Biochimica et biophysica acta : Molecular Cell Research. Amsterdam: Elsevier, 2023, roč. 1870, č. 7, s. 1-16. ISSN 0167-4889. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.bbamcr.2023.119489.

ATANASOVA, Velina S, Crhistian de Jesus CARDONA, Václav HEJRET, Andreas TIEFENBACHER, Theresia MAIR, Loan TRAN, Janette PFNEISSL, Kristina DRAGANIC, Carina BINDER, Julijan KABILJO, Janik CLEMENT, Katharina WOERAN, Barbara NEUDERT, Sabrina WOHLHAUPTER, Astrid HAASE, Sandra DOMAZET, Markus HENGSTSCHLAEGER, Markus MITTERHAUSER, Leonhard MUELLAUER, Boris TICHÝ, Michael BERGMANN, Gabriele SCHWEIKERT, Markus HARTL, Helmut DOLZNIG a Gerda EGGER. Mimicking Tumor Cell Heterogeneity of Colorectal Cancer in a Patient-derived Organoid-Fibroblast Model. CELLULAR AND MOLECULAR GASTROENTEROLOGY AND HEPATOLOGY. UNITED STATES: ELSEVIER INC, 2023, roč. 15, č. 6, s. 1391-1419. ISSN 2352-345X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.jcmgh.2023.02.014.

JEDLIČKOVÁ, Veronika, Václav HEJRET, Martin DEMKO, Pavel JEDLIČKA, Marie ŠTEFKOVÁ a Helene ROBERT BOISIVON. Transcriptome analysis of thermomorphogenesis in ovules and during early seed development in Brassica napus. BMC Genomics. London: BioMed Central Ltd, 2023, roč. 24, č. 1, s. 1-15. ISSN 1471-2164. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12864-023-09316-2.

DOSTÁLOVÁ, Lenka, Aneta LEDEREROVÁ, Helena PESCHELOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. CRISPR/Cas9 knockout screening revealed genes involved in CD20 regulation. In Annual PhD conference Biomedical sciences, Brno. 2022.

PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Robert HELMA, Šárka PAVLOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Distinct p53 phosphorylation patterns in chronic lymphocytic leukemia patients are reflected in circumjacent pathways activation upon DNA damage. In Mendel genetics Conference 2022. 2022.

PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Robert HELMA, Šárka PAVLOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Distinct p53 phosphorylation patterns in chronic lymphocytic leukemia patients are reflected in circumjacent pathways activation upon DNA damage. In EHA 2022 in HemaSphere 2022; 6(S3): 976. 2022.

PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Robert HELMA, Šárka PAVLOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jakub HYNŠT, Karla PLEVOVÁ, Jana KOTAŠKOVÁ, Jitka MALČÍKOVÁ a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Distinct p53 phospohrylation patterns in chronic lymphocytic leukemia patients are reflected in circumjacent pathways activation upon DNA damage. In PhD retreat 2022, Telč. 2022.

FROHLICH, Jan, Kristina KOVACOVICOVA, Marco RAFFAELE, Tereza VIRGLOVA, Eliska CIZKOVA, Jan KUČERA, Julie DOBROVOLNÁ, Martin WABITSCH, Marion PEYROU, Francesca BONOMINI, Rita REZZANI, George N. CHALDAKOV, Anton B. TONCHEV, Michelino DI ROSA, Nicolas BLAVET, Václav HEJRET a Manlio VINCIGUERRA. GDF11 inhibits adipogenesis and improves mature adipocytes metabolic function via WNT/beta-catenin and ALK5/SMAD2/3 pathways. Cell Proliferation. 2022, roč. 55, č. 10, s. 1-15. ISSN 0960-7722. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/cpr.13310.

KLIMENTOVÁ, Eva, Václav HEJRET, Katarína GREŠOVÁ, Ilektra-Chara GIASSA a Panagiotis ALEXIOU. miRBind: a Deep Learning method for miRNA binding classification. 2022. ISBN 978-80-7592-127-7.

KLIMENTOVÁ, Eva, Václav HEJRET, Ján KRČMÁŘ, Katarína GREŠOVÁ, Ilektra-Chara GIASSA a Panagiotis ALEXIOU. miRBind: A Deep Learning Method for miRNA Binding Classification. GENES. MDPI, 2022, roč. 13, č. 12, s. 2323-2335. ISSN 2073-4425. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/genes13122323.

HEJRET, Václav, Nandan Mysore VARADARAJAN, Eva KLIMENTOVÁ, Ilektra-Chara GIASSA, Štěpánka VAŇÁČOVÁ a Panagiotis ALEXIOU. Noncanonical small RNA chimeras identified by AGO2-CLASH. In 16th Microsymposium on RNA Biology. 2022.

MARTINO, Fabiana, Nandan Mysore VARADARAJAN, Ana Rubina PERESTRELO, Václav HEJRET, Helena DURIKOVA, Dragana VUKIĆ, Vladimir HORVATH, Francesca CAVALIERI, Frank CARUSO, Waleed S ALBIHLAL, Andre P GERBER, Mary Anne O'CONNELL, Štěpánka VAŇÁČOVÁ, Stefania PAGLIARI a Giancarlo FORTE. The mechanical regulation of RNA binding protein hnRNPC in the failing heart. Science Translational Medicine. Washington: American Association for the Advancement of Science, 2022, roč. 14, č. 672, s. 1-17. ISSN 1946-6234. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1126/scitranslmed.abo5715.

MURESAN, Ximena M., Eva SLABÁKOVÁ, Jiřina PROCHÁZKOVÁ, Stanislav DRÁPELA, Radek FEDR, Markéta PÍCKOVÁ, Ondřej VACEK, Ráchel VÍCHOVÁ, Tereza SUCHÁNKOVÁ, Jan BOUCHAL, Daniela KÜRFÜRSTOVÁ, Milan KRÁL, Tereza HULÍNOVÁ, Radek P. SÝKORA, Vladimír ŠTUDENT, Václav HEJRET, Wytske M. VAN WEERDEN, Martin PUHR, Václav PUSTKA, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Zoran CULIG a Karel SOUČEK. Toll-Like Receptor 3 Overexpression Induces Invasion of Prostate Cancer Cells, whereas Its Activation Triggers Apoptosis. American Journal of Pathology. Elsevier, 2022, roč. 192, č. 9, s. 1321-1335. ISSN 0002-9440. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ajpath.2022.05.009.

MURESAN, Ximena M., Eva SLABÁKOVÁ, Jiřina PROCHÁZKOVÁ, Stanislav DRÁPELA, Radek FEDR, Markéta PÍCKOVÁ, Ondřej VACEK, Ráchel VÍCHOVÁ, Tereza SUCHÁNKOVÁ, Jan BOUCHAL, Daniela KÜRFÜRSTOVÁ, Milan KRÁL, Tereza HULÍNOVÁ, Radek P. SÝKORA, Vladimír ŠTUDENT, Václav HEJRET, Wytske M. VAN WEERDEN, Martin PUHR, Václav PUSTKA, David POTĚŠIL, Zbyněk ZDRÁHAL, Zoran CULIG a Karel SOUČEK. Toll-Like Receptor 3 Overexpression Induces Invasion of Prostate Cancer Cells, whereas Its Activation Triggers Apoptosis. American Journal of Pathology. Elsevier, 2022, roč. 192, č. 9, s. 1321-1335. ISSN 0002-9440. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ajpath.2022.05.009.

PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Robert HELMA, Jitka MALČÍKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jana KOTAŠKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Fosforylace proteinu p53: vliv na aktivitu dráhy p53 po poškození DNA u chronické lymfocytární leukémie. In II. Český hematologický a transfuziologický sjezd v Transfuze a Hematologie Dnes (2021). 2021.

PEŠOVÁ, Michaela, Veronika MANČÍKOVÁ, Šárka PAVLOVÁ, Robert HELMA, Jitka MALČÍKOVÁ, Marcela ŽENATOVÁ, Václav HEJRET, Petr TAUŠ, Jana KOTAŠKOVÁ, Karla PLEVOVÁ, Michael DOUBEK, Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Phosphorylation patterns of tumor suppressor P53 and their impact on the P53 pathway activity in chronic lymphocytic leukemia. In XIX International Workshop on Chronic Lymphocytic Leukemia (iwCLL). 2021.

ŠTĚTKOVÁ, Monika, Kateřina GROWKOVÁ, Petr FOJTÍK, Barbora VALČÍKOVÁ, Veronika PALUŠOVÁ, Amandine VERLANDE, Radek JORDA, Vladimír KRYŠTOF, Václav HEJRET, Panagiotis ALEXIOU, Vladimír ROTREKL a Stjepan ULDRIJAN. CDK9 activity is critical for maintaining MDM4 overexpression in tumor cells. CELL DEATH & DISEASE. LONDON: NATURE PUBLISHING GROUP, 2020, roč. 11, č. 9, s. 1-14. ISSN 2041-4889. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41419-020-02971-3.

PESCHELOVÁ, Helena, Veronika KOZLOVÁ, Veronika MANČÍKOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. CRISPR/CAS9 technology: a useful tool in the study of chronic lymphocytic leukemia. In XXth Interdisciplinary meeting of young researchs and students in the field of chemistry, biochemistry, molecular biology and biomaterials in Chemické listy. 2020. ISSN 2336-7202.

PESCHELOVÁ, Helena, Lenka DOSTÁLOVÁ, Veronika KOZLOVÁ, Aneta LEDEREROVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. Genome-wide CRISPR/Cas9 screening reveals novel target genes, whose inactivation is able to upregulate surface expression of immunotherapy target CD20. In 25th Congress of European Hematology Association, Amsterdam, Nizozemsko, in HemaSphere. 2020.

PESCHELOVÁ, Helena, Veronika KOZLOVÁ, Veronika MANČÍKOVÁ, Adriana LADUNGOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. The use of CRISPR/Cas9 technology in the study of chronic lymphocytic leukemia. In CEITEC PhD Conference. 2020.

PESCHELOVÁ, Helena, Veronika KOZLOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. CRISPR/Cas9 gene editing and functional screening in chronic lymphocytic leukemia. In Joint retreat 2019, Kouty u Ledče nad Sázavou. 2019. ISBN 978-80-210-9300-3.

PESCHELOVÁ, Helena, Veronika KOZLOVÁ, Václav HEJRET a Michal ŠMÍDA. The use of CRISPR/Cas9 technology in the study of chronic lymphocytic leukemia. In Biomania, Brno. 2019.

HEJRET, Václav, Stanislav GEIDL, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. ChrgDescCalc.py – nástroj na výpočet nábojových deskriptorů. In ENBIK - Národní bioinformatická konference. 2016. ISBN 978-80-7080-960-0.

RAČEK, Tomáš, Jana PAZÚRIKOVÁ, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Stanislav GEIDL, Aleš KŘENEK, Francesco Luca FALGINELLA, Vladimír HORSKÝ, Václav HEJRET a Jaroslav KOČA. NEEMP: software for validation, accurate calculation and fast parameterization of EEM charges. Journal of Cheminformatics. London: BIOMED CENTRAL LTD, 2016, roč. 8, October, s. nestránkováno, 14 s. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13321-016-0171-1.

GEIDL, Stanislav, Václav HEJRET, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ a Jaroslav KOČA. Využití nábojových deskriptorů v chemoinformatice. In ENBIK - Národní bioinformatická konference. 2016. ISBN 978-80-7080-960-0.

GEIDL, Stanislav, Tomáš BOUCHAL, Tomáš RAČEK, Radka SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ, Václav HEJRET, Aleš KŘENEK, Ruben ABAGYAN a Jaroslav KOČA. High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications. Journal of Cheminformatics. London: BIOMED CENTRAL LTD, 2015, roč. 7, DEC, s. 1-10. ISSN 1758-2946. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s13321-015-0107-1.