Diplomová práce

Tvorba fosforylační mapy proteinu Dishevelled

Description of Dishevelled phosphorylation map

Bc. Matěj Rádsetoulal
Anotace

Proteiny jsou častým cílem posttranslačních modifikací, které jim dávají nové vlastnosti. V této diplomové práci jsme se zabývali proteinem Dishevelled, který je jednou z podstatných komponent signalizace Wnt a který reguluje její průběh. Pomocí hmotnostní spektrometrie jsme analyzovali fosforylace proteinu hDVL3 indukované osmi asociovanými kinázami přičemž byly nalezeny desítky fosforylovaných aminokyselin …více

Abstract

Proteins are frequent targets of posttranslational modifications, which give them new properties. In this thesis we studied Dishevelled protein, essential component of Wnt signalling pathway that contributes to their regulation. We performed mass spectrometric analysis of hDVL3 phosphorylations induced by eight associated kinases, which revealed several dozens of phosphorylation sites. Main outcome …více

Zadání práce
Posttranslační modifikace jsou jedním ze způsobů, kterými jsou ovlivňovány vlastnosti proteinů, jako jsou stabilita, lokalizace, aktivita, sekrece a v neposlední řadě také vazba na jiné proteiny. Mezi nejznámější posttranslační modifikace řadíme fosforylace. Nezbytnost proteinu Dishevelled (Dvl) pro Wnt signální dráhy je známá již více než 20 let, a přibližně stejnou dobu je známé, že je tento protein fosforylován. V průběhu let bylo řadou publikací identifikováno několik kináz, které tento protein fosforylují, ale to, která specifická aminokyselinová residua jsou těmito kinázami fosforylována, nebylo dostatečně analyzováno. Komplexitu tohoto problému nastiňuje fakt, že prozatím bylo u Dvl identifikováno více než 60 různých fosforylačních míst, ale funkční důsledky, které tyto fosforylace mají, byly identifikovány pouze u zlomku těchto míst. Student bude navazovat na již publikované studie a pomocí kvantitativní hmotnostní spektrometrie bude analyzovat, která místa proteinu Dvl jsou fosforylována kterou kinázou. Zároveň bude pomocí sady 8 protilátek proti specifickým fosfoserinům/fosfothreoninům Dvl analyzovat, zda dochází k rozdílné fosforylaci těchto míst v závislosti na kináze. Residua, u kterých bude nalezen rozdíl ve fosforylaci, budou mutována na alanin a bude testován jejich vliv na „downstream“ signalizaci.
Práce zkontrolována:
17. 5. 2016 08:40, prof. Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D., učo 11088
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
3. 6. 2016
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Vítězslav Bryja, Ph.D., učo 11088
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

doc. Mgr. Tomáš Bárta, Ph.D., učo 106061

Konzultant

Mgr. Ondřej Bernatík, Ph.D., učo 106655
ÚEB Biol PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.