Bakalářská práce

Modul na kvantitativní analýzu a vizualizaci výsledků trackování živých buněk

Module for the Quantitative Analysis and Visualization of Live-Cell Tracking Results

Adriana Šmijáková
Anotace

Práca sa zaoberá spracovaním výsledkov trackovacích algoritmov, ktoré vytvoria účastníci Súťaže na trackovanie buniek. Cieľom je vizualizovať výsledky vo forme tabuľky, kvantitatívne ich analyzovať, umožniť výber podmnožiny výsledkov a taktiež ich porovnať s referenčnými výsledkami. Výstupom je aplikácia s grafickým používateľským prostredím napísaná v programovacom jazyku C++, ktorá poskytuje túto funkcionalitu a je plne funkčná v prostredí Linux aj Windows.

Abstract

This thesis is dedicated to processing results of cell-tracking algorithms which were created by participants of Cell Tracking Challenge. The aim is to visualize results in the form of table, analyse results quantitatively, allow to select a subset of results and also compare them with the reference results. The output is application with graphical user interface written in programming language C++, providing this functionality in the Linux and Windows environment.

Klíčová slova
trackovanie acyklický orientovaný graf vizualizácia GUI C/C++
Zadání práce
Cílem práce je naimplementovat aplikaci umožňující kvantitavní analýzu a vizualizaci výsledků trackování živých buněk ve fluorescenční mikroskopii. Tyto výsledky lze matematicky popsat pomocí acyklického orientovaného grafu. Uzly takového grafu představují buňky detekované v jednotlivých časových snímcích, jejichž korespondence v čase je reprezentována pomocí hran daného grafu. Na základě pokynů vedoucího musí aplikace umožňovat:
  • vizualizaci výsledků trackování živých buněk v tabulkové formě, včetně porovnání s referenčními výsledky;
  • zobrazení různých kvantitativních charakteristik, zejména počtu buněk a dělení a velikosti detekovaných objektů;
  • výběr části grafu splňující uživatelem zadané podmínky.
Aplikace bude napsána v jazyce C++, dobře dokumentována a plně funkční v prostředí Windows i Linux.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
19. 5. 2014 21:37, doc. RNDr. Martin Maška, Ph.D., učo 60734
Plný text práce
11 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
18. 6. 2014
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Martin Maška, Ph.D., učo 60734
CABO FI MU

Oponent

doc. RNDr. David Svoboda, Ph.D., učo 2824
KVI FI MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
Archiv závěrečné práce Adriana Šmijáková FI B-IN GRA b9jy1/7
Drštková, E.
4. 3. 2014
Složky
Soubory
Anotace anglicky annotation_english.txt
Šmijáková, A.
18. 5. 2014
Anotace česky annotation.txt
Šmijáková, A.
16. 5. 2014
Klíčová slova keywords.txt
Šmijáková, A.
16. 5. 2014
Plný text práce thesis.pdf
Šmijáková, A.
16. 5. 2014
Posudek oponenta posudek.pdf
Svoboda, D.
5. 6. 2014
Posudek vedoucího posudek_fhkarnip.pdf
Maška, M.
6. 6. 2014
Příloha sourceCodes.zip
Šmijáková, A.
19. 5. 2014

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.