Bakalářská práce

Simulace van der Waalsovy interakce s pohyblivou molekulou

Simulation of van der Waals interaction with a flexible receptor

Martin Szabo, učo 324563
Anotace

Na Fakulte Informatiky a Ústavu výpočetní techniky Masarykovy univerzity sa už dlhšiu dobu vyvíja aplikácia haptickej (hmatovej) interakcie dvoch molekúl. Jej cieľom je simulovať interakcie dvoch molekúl a pomocou haptického rozhrania umožniť užívateľovi ovládať jednu z nich. Doterajšia implementácia bola limitovaná na molekuly nemenného tvaru, čo ale nezodpovedá realite modelovaných dejov. Kľúčovou …více

Abstract

Faculty of Informatics and Institute of Computer Science of Masaryk University develop applications of haptic (tactile) interaction of two molecules. Its aim is to simulate the interaction of two molecules and by using haptic interfaces allow the user to control one of them. The current implementation has been limited to molecules of unchanging shape, but this does not reflect reality modeling processes …více

Klíčová slova
Haptika van der Waalsove sily hashovanie rozdelenie priestoru Phantom molekulový docking
Zadání práce
Na FI a ÚVT MU je delší dobu vyvíjena aplikace haptické (hmatové) interakce dvou molekul. Současná implementace je omezena na molekuly zafixovaného tvaru, což příliš neodpovídá realitě modelovaných dějů. Klíčovou složkou silové interakce jsou van der Waalsovy síly, které vyhodnocujeme v reálném čase s použitím hashovací vyhledávací struktury.

Cílem práce je na základě existujícího rámcového návrhu implementovat vyhledávací strukturu, která se bude přeorganizovávat na základě změn tvaru jedné z interagujících molekul.

Předpokládá se základní znalost programování v C/C++ v prostředí Linuxu, výhodou je znalost principů prostorových vyhledávacích datových struktur. Znalosti problematiky výpočetní chemie nejsou nezbytné.

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
25. 5. 2011 15:19, Mgr. Aleš Křenek, Ph.D., učo 3086
Plný text práce
407 KB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
24. 6. 2011
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Aleš Křenek, Ph.D., učo 3086
CUSupp ScColl CERIT-SC ÚVT MU

Oponent

RNDr. Jan Fousek, Ph.D., učo 172693
NEU5 CN CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Aplikovaná informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.