Závěrečná práce: Bc. Michal Ďurech: In silico predikce vazebných vlastností lektinu RS20L
Diplomová práce
In silico predikce vazebných vlastností lektinu RS20L
In silico prediction of lectin RS20L binding properties
Anotace
Táto práca bola zameraná na in silico štúdium väzbových vlastností lektínu RS20L metódou molekulárneho dokovania a simuláciou molekulovej dynamiky. Lektín obsahuje dva typy väzbových miest, ktoré sa pravdepodobne líšia v sacharidovej špecifite. V žliabkovom mieste boli identifikované tri molekuly vody, ktoré by potenciálne mohli sprostredkovať interakciu medzi lektínom a sacharidom, z ktorých dve boli …více
Abstract
This thesis is focused on in silico prediction of binding properties of Ralstonia solanacearum lectin RS20L by means of molecular docking and molecular dynamics simulations. In lectin RS20L there were identified two types of binding sites probably with different sugar specificity. Three water molecules were found in a groove binding site which could mediate saccharide binding to the lectin structure …více
11. 5. 2011 09:54, prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D., učo 854
Vedoucí
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Studium lektinů z patogenních organismů
Mgr. Petra Sýkorová, Ph.D., učo 364193 -
Homologní modelování a virtuální screening potenciálních inhibitorů intelektinu
Mgr. Veronika Horská -
Fyziologické změny rostlin vyvolané interakcí s mikroorganismy
Mgr. Viktória Pirková -
Structure-functional analysis and molecular modeling of interactions of bacterial lectins and saccharides
Ing. et Ing. Jan Adam, Ph.D., učo 151533 -
Studium lektinů z patogenních organismů a jejich aplikace
Mgr. Lukáš Faltinek, Ph.D., učo 433144 -
Molekulární modelování bakteriálních glykanů a jejich interakcí
Mgr. Tereza Tutková -
Saccharide-recognizing proteins involved in pathogenesis
Mgr. Jan Komárek, Ph.D., učo 175127 -
Molekulové modelování lektinů a glykosyltransferáz
Mgr. Lenka Šnajdrová, Ph.D., učo 14128




