Diplomová práce

Zapojení katalytické podjednotky telomerázy do regulace genové exprese

Involvement of the catalytic telomerase subunit in gene expression regulation

Bc. Jana Porubská, učo 436837
Anotace

Hlavní úkol telomerázy je prodlužování telomer, které jsou na koncích eukaryotických chromozomů. Tento enzým je zapojen ale i do celé řady netelomerických procesů. Především se jich účastní katalytická podjednotka zvaná TERT, která interaguje s řadou dalších proteinů. Tato diplomová práce se věnuje zmapování poznatků o vztahu regulace genové exprese atelomerázy, analýze délek telomer a telomerázové …více

Abstract

The main role of telomerase is to enlogate telomeres at the end of eukaryotic chromosomes. This enzyme is also involved in a number of non-telomeric processes. Mainly the catalytic subunit of telomerase is involved, which interacts with a number of other proteins. In this master’s thesis the knowledge about the relationship between gene expression regulation and telomerase will be mapped, including …více

Zadání práce
Již po několik desetiletí je známo, že telomeráza je speciální reverzní transkriptáza schopná prodlužovat telomery tvořící přirozené konce lineárních chromozomů. Telomeráza je ribonukleoproteinový komplex složený z proteinové katalytické podjednotky (TERT) a RNA podjednotky, jejíž část slouží jako templát pro syntézu telomerové DNA. Bez přítomnosti aktivní telomerázy v buňce se konce lineárních chromozomů postupně zkracují v důsledku neschopnosti DNA-polymeráz replikovat úplný konec opožďujícího se vlákna DNA. Buňky, u nichž dochází k postupnému zkracování telomer, mohou projít pouze omezeným počtem buněčných dělení před tím, než zestárnou a odumřou. Prodlužování telomer prostřednictvím telomerázy dává buňkám předpoklad k neomezenému dělení. V poslední době se ukazuje, že telomeráza má i další funkce, které nesouvisí s prodlužováním telomer. V lidských buňkách katalytická podjednotka telomerázy přispívá nezávisle na prodlužování telomer k stimulaci buněčného dělení, k potlačení apoptózy a k regulaci odpovědi buňky na poškození DNA. Mechanismus, jakým je telomeráza do těchto procesů zapojena, není přesně znám. Dá se předpokládat, že se tak děje prostřednictvím interakcí s dalšími faktory a vytvářením multiproteinových komplexů, které ovlivňují expresi genů kódujících proteiny s proliferačním a anti-apoptotickým účinkem. V rámci diplomové práce bude u předpokládaných interakčních partnerů telomerázy z Arabidopsis thaliana testováno jejich zapojení do regulace exprese vybraných genů. Do této studie budou podle dříve provedené tandemové afinitní purifikace (DP Jana Majerská,2012) zařazeny proteiny interagující s telomerázou, u kterých je na základě dostupných informací předpoklad, že by mohly být do regulace exprese genů zapojeny. U mutantních linií Arabidopsis thaliana s vloženou T-DNA v genu zájmu bude testován vliv ztráty funkce tohoto genu na regulaci transkripce vybraných genů včetně genu kódujícího TERT, na hladinu telomerázové aktivity, případně i na délku telomer. Pomocí kvasinkového dvouhybridního testu (Y2H) bude zjišťováno, zda se jedná o přímé interakční partnery telomerázy. Doporučená literatura: 1. Majerska J, Sykorova E, Fajkus J (2011) Non-telomeric activities of telomerase. Mol BioSyst 7: 1013-1023 2. Saretzki G (2009) Telomerase, mitochondria and oxidative stress. Experimental Gerontology 44: 485-492 3. Chiodi I, Mondello Ch (2012) Telomere-independent functions of telomerase in nuclei, cytoplasm, and mitochondria. Frontiers in Oncology 2: 133
Práce zkontrolována:
14. 8. 2020 06:18, Mgr. Jana Fulnečková, Ph.D., učo 8208
Plný text práce
5,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
8. 9. 2020
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Jana Fulnečková, Ph.D., učo 8208
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Michal Franek, Ph.D., učo 357550
MKChr MCGPR CEITEC MU

Konzultant

Mgr. Eva Sýkorová, CSc., učo 26127
ext NCBR PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.