Bakalářská práce

Screening izolovaných nebo nově vyvinutých biokatalyzátorů s vysokou stabilitou a aktivitou in vitro a in vivo

Screening of isolated or newly developed biocatalysts with high stability and activity in vitro and in vivo

Petra Szelcsányiová, učo 358209
Anotace

Screeningové metody jsou nezbytnou součástí moderního výzkumu biomolekul. Cílem vědců je objevit takovou metodu, která bude rychlá, cenově přijatelná, časově a metodicky nenáročná a v neposlední řadě dostatečně účinná. Bakalářská práce obsahuje popis základních metod vhodných ke stanovení aktivity a stability enzymů a navrhuje optimální techniky pro testování halogenalkandehalogenas. První tři kapitoly …více

Abstract

Screening methods represent important part of modern biomolecular reseach. The aim of many scientists is to discover sophisticated, cheap, fast and simple method for determinination of enzyme activity and stability. This bachelor thesis includes description of basic methods for determinination protein stability and activity and suggests optimal techniques for testing of haloalkane dehalogenases. Initial …více

Klíčová slova
Halogenalkandehalogenasy enzymy screeningové metody aktivita stabilita Haloalkane dehalogenases enzymes screening methods activity stability
Zadání práce
Efektivní využití biokatalyzátorů v průmyslových aplikacích vyžaduje dostupnost vhodných enzymů s vysokou aktivitou a stabilitou za provozních podmínek, požadovanou substrátovou specifitou a enantioselektivitou. Vlastnosti biokatalyzátorů je třeba často optimalizovat, aby tyto požadavky splnily. Jedním ze způsobů přípravy biokatalyzátoru s požadovanými vlastnostmi reprezentují metody proteinového inženýrství: racionální design a řízená evoluce. Dalším způsobem získání biokatalyzátoru s optimálními vlastnostmi představuje izolace nových enzymů z mořských nebo extrémofilních mikroorganismů nebo vyhledávání předpokládaných genů cílových enzymů v genomických databázích. Ve všech případech je třeba vybrat z velkého množství předpokládaných nebo modifikovaných biokatalyzátorů ty, které vykazují požadované vlastnosti pomocí vhodné screeningové metody. Enzymy studované na našem pracovišti se nazývají halogenalkandehalogenasy (EC 3.8.1.5). Halogenalkandehalogenasy jsou bakteriální enzymy schopné hydrolyticky štěpit vazbu uhlík-halogen v širokém spektru halogenovaných alifatických uhlovodíků. Nejprostudovanější dehalogenasy byly izolovány z bakterií Xanthobacter autotrophicus GJ10, Rhodococcus sp. TDTM0003, Sphingobium japonicum UT26, Mycobacterium tuberculosis H37Rv a Bradyrhizobium japonicum USDA110. Zájem o tyto enzymy neustále narůstá vzhledem k jejich potenciálnímu využití v bioremediacích pro degradaci toxických látek, v biosensorech k detekci škodlivých látek v životním prostředí a v biosyntézách na výrobu léčiv a agrochemikálií. Cílem bakalářské práce bude literární rešerše shrnující různé screeningové techniky využívané pro selekci biokatalyzátorů s vylepšenou/požadovanou stabilitou a aktivitou. Výstupem bakalářské práce bude návrh vhodné techniky/technik pro „high-throughput screening“ velkého množství modifikovaných nebo putativních enzymů halogenalkandehalogenas s vysokou stabilitou a aktivitou in vivo a in vitro. Dalším výstupem bakalářské práce bude návrh „high-throughput screeningu“ pro měření substrátových specifit, teplotních a pH profilů purifikovaných halogenalkandehalogenas.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
15. 5. 2012 08:30, doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D., učo 16143
Plný text práce
939 KB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
19. 6. 2012
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D., učo 16143
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Konzultant

prof. RNDr. Zbyněk Prokop, Ph.D., učo 23696
Kinet ProtIng RECETOX PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.