Diplomová práce

Studium interakcí mezi polyvalentním bakteriofágem a hostitelským kmenem Staphylococcus aureus

Study of polyvalent phage-host Staphylococcus aureus interactions

Bc. Ondřej Mrkva
Anotace

Tato práce je zaměřena na studium interakcí mezi polyvalentním bakteriofágem a jeho hostitelem Staphylococcus aureus na transkriptomické úrovni. V práci byla optimalizována metoda izolace a purifikace RNA. Následně byla studována exprese fágového transkripčního faktoru a endolyzinu v průběhu fágové infekce.

Abstract

This thesis is focused on the study of interactions between polyvalent bacteriophage and its host of Staphylococcus aureus at the transcriptomic level. RNA isolation and purification method has been optimized. Subsequently, expression of phage transcription factor and endolysin was studied during phage infection.

Klíčová slova
Bakteriofág K Staphylococcus aureus transkriptomická analýza qPCR izolace RNA fágová terapie Bacteriophage K transcriptome analysis RNA isolation phage therapy
Zadání práce
Cílem práce bude studium interakcí mezi bakteriálním kmenem S. aureus a polyvalentním fágem během infekce pomocí transkriptomické analýzy. Student bude v prvním kroku optimalizovat metodiku izolace RNA pomocí komerčně dostupných kitů u druhu Staphylococcus aureus, přípravu cDNA. Dalším cílem bude studium transkriptomu v různých fázích fágové infekce. Hlavním výstupem práce bude příprava knihovny pro analýzu transkriptomu pomocí sekvenování nové generace na přístroji Ion PGM. Osnova práce: 1. optimalizace izolace RNA z bakterií druhu S. aureus 2. izolace RNA v různých fázích fágové infekce 3. zpětná transkripce do cDNA 4. analýza transkriptomu pomocí Ion PGM
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
5. 1. 2018 18:43, Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D., učo 106011
Plný text práce
3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
13. 2. 2018
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D., učo 106011
Pracoviště výzkumu genomu Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Kamila Bendíčková, Ph.D., učo 184642
VSJF MCKV FN USA LF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.