Diplomová práce

Možnost využití Ramanovy spektroskopie při identifikaci mikroorganismů způsobujících infekce krevního řečiště

Potential of Raman spectroscopy for identification of microorganisms causing bloodstream infections

Bc. Jan Mašek, učo 460802
Anotace

Ramanova spektroskopie je metodou vibrační spektroskopie. Vychází z Ramanova jevu, neelastického rozptylu světla při interakci monochromatického záření s molekulou. Jedná se o nedestruktivní techniku, jež nachází uplatnění v analýze jednotlivých molekul i komplexních struktur. V posledních letech si tato metoda získává větší pozornost i při analýze biologického materiálu, včetně mikrobiálních buněk …více

Abstract

Raman spectroscopy is a method of vibrational spectroscopy. It is based on inelastic light scattering during interaction between monochromatic light and a molecule. It is a non-destructive method which serves as a useful tool in analysis of various substances, from molecules to complex structures. In recent years, the method is also gaining attention in the field of analysis of biological samples including …více

Zadání práce
Ramanova spektroskopie patří k metodám vibrační molekulové spektroskopie. Je založená na fyzikálním jevu, neelastickém optickém rozptylu, ke kterému dochází při interakci laserového paprsku s elektrony zkoumaného materiálu. Tato metoda je vhodná na identifikaci látek, jejich složení a struktury. V současnosti narůstá její význam při analýze biologických systémů – od biomolekul po živé organismy. Práce se bude zabývat možností rozlišit jednotlivé druhy mikrobů podílející se na infekcích krevního řečiště, případně sledovat jejich faktory virulence, pomocí Ramanovy spektroskopie.

Literatura:
Samek O, Al-Marashi J F M, Telle H H. The potential of Raman spectroscopy for the identification of biofilm formation by Staphylococcus epidermidis. Laser Phys. Lett. 7, 378–383 (2010).
Samek O, Telle HH, Harris LG, Bloomfield M, Mack D. Raman spectroscopy for rapid discrimination of Staphylococcus epidermidis clones related to medical device-associated infections. Laser Phys. Lett. 5, 465–470 (2008).
Bernatova S, Samek O, Pilat Z et al. Following the mechanisms of bacteriostatic versus bactericidal action using Raman spectroscopy. Molecules 18, 13188–13199 (2013).
Samek O, Jonaš A, Pilat Z et al. Raman microspectroscopy of individual algal cells: Sensing unsaturation of storage lipids in vivo. Sensors 10, 8635–8651 (2010).
Neugebauer U, Rosch P, Popp J. Raman spectroscopy towards clinical application: drug monitoring and pathogen identification. Int. J. Antimicrob. Agents 46, S35–S39 (2015).
Kotanen C N, Martinez L, Alvarez J, Simecek J W. Surface enhanced Raman scattering spectroscopy for detection and identification of microbial pathogens isolated from human serum. Sens Biosensing Res. 8, 20–26 (2016).
Pahlow S, Meisel S, Cialla-May D, Weber K, Rosch P, Popp J. Isolation and identification of bacteria by means of Raman spectroscopy. Adv. Drug Deliv. Rev. 89, 105–120 (2015).
Rebrošová K, Šiler M, Samek O et al. Rapid identification of staphylococci by Raman spectroscopy. Sci. Rep. 7, 1–8 (2017).
Mlynáriková K, Samek O, Bernatová S et al. Influence of Culture Media on Microbial Fingerprints Using Raman Spectroscopy. Sensors 15, 29635–29647 (2015).
Práce zkontrolována:
10. 1. 2022 07:36, prof. MUDr. Filip Růžička, Ph.D., učo 1100
Plný text práce
2,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
31. 1. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. MUDr. Filip Růžička, Ph.D., učo 1100
MiÚ FN USA LF MU

Oponent

Mgr. Ota Samek, Ph.D.
Ústav přístrojové techniky Akademie věd České republiky, v. v. i. Královopolská 147 612 64 Brno

Konzultant

Mgr. Katarína Rebrošová, učo 358289
MiÚ FN USA LF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.