Diplomová práce

Identifikace vazebných partnerů CDK13 pomocí BioID technologie

Identification of CDK13-associating partners by use of BioID technology

Bc. Šimon Sládek
Anotace

Diplomová práce se zabývá identifikací vazebných partnerů cyklin-dependentní kinázy 13 (CDK13), která hraje klíčovou roli v regulaci transkripce a buněčných procesů důležitých pro embryonální vývoj. Pomocí metody proximální biotinylace BioID byl v myších embryonálních fibroblastech analyzován proximální interaktom CDK13. Získaná proteomická data byla vyhodnocena bioinformatickými nástroji s cílem identifikovat proteiny a buněčné dráhy asociované s funkcí CDK13.

Abstract

This diploma thesis focuses on the identification of binding partners of cyclin-dependent kinase 13 (CDK13), a key regulator of transcription and cellular processes essential for embryonic development. Using the BioID proximity labeling approach, the proximal interactome of CDK13 was analyzed in mouse embryonic fibroblasts. The obtained proteomic data were further evaluated using bioinformatic tools to identify proteins and cellular pathways associated with CDK13 function.

Klíčová slova
CDK13 cyklin-dependentní kináza protein-proteinové interakce proximální interaktom BioID transkripční elongace cyclin-dependent kinase protein-protein interactions proximal interactome transcriptional elongation
Zadání práce
Zástupci rodiny cyklin-dependentních kináz (CDK) se účastní v regulaci celé řady buněčných pochodů a fyziologických procesů. Ztráta funkce CDK13 je pro organismus kritická a vede k embryonální letalitě, nicméně buněčné procesy, které jsou negativně ovlivněny ztrátou aktivity CDK13 jsou zatím neznámé. Cílem diplomové práce bude určení funkce CDK13 v buněčných procesech jejichž deregulace vede k nesprávnému vývoji myšího embrya a identifikaci vazebných partnerů. Za tímto účelem budou připraveny myší embryonální fibroblasty s expresí fúzního proteinu CDK13 a biotin ligázy. Očekávanými cíli plánovaných studií je nalezení asociačních partnerů CDK13 uplatňujících se v regulaci nejen transkripce ale dalších specifických buněčných procesů.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
8. 1. 2026 08:48, doc. Mgr. Jiří Kohoutek, Ph.D., učo 19829
Plný text práce
3,5 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
4. 2. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Jiří Kohoutek, Ph.D., učo 19829
Genet ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Tomáš Gybeľ, Ph.D., učo 422952
Zivoc ÚEB Biol PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví - Lékařská genetika a molekulární diagnostika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.