Závěrečná práce: Nicole Kovaříková: Identifikace čtyřřetězcových struktur DNA pomocí imunochemických metod
Bakalářská práce
Identifikace čtyřřetězcových struktur DNA pomocí imunochemických metod
Immunochemical identification of tetra-stranded DNA structures
Anotace
V posledních letech se stal středem zájmů vědců výzkum sekundární struktury nukleových kyselin, a to zejména ve spojitosti s léčbou rakoviny. G-kvadruplexy jsou čtyřřetězcové struktury, ve kterých guaninové báze vytvářejí stabilní kvadruplexové uspořádání. Tyto struktury hrají důležitou roli v regulaci genové exprese, replikaci DNA a dalších buněčných procesech. Jejich studium je stále intenzivně zkoumaným …více
Abstract
In recent years, research into the secondary structure of nucleic acids has become the focus of scientists, particularly in the context of cancer treatment. G-quadruplexes are four-stranded structures in which guanine bases form stable qu-adruplex arrangements. These structures play an important role in the regulation of gene expression, DNA replication, and other cellular processes. Their study remains …více
Zadání práce
Molekula DNA je za standardních podmínek uložena v buňkách ve formě dvouvláknové pravotočivé šroubovice. Za specifických podmínek jsou však určité oblasti DNA schopny nabývat odlišné sekundární struktury, takzvaného guaninového kvadruplexu (G4). Pomocí metod NGS bylo v rámci lidského genomu identifikováno více než 700 000 oblastí schopných tvorby G4. Tyto se nacházejí hlavně v regulačních oblastech genů a v oblastech telomer. Jednou z možností detekce existence G4 in vivo je využití G4-specifických protilátek. Komerčně dostupné varianty protilátek však dle dostupných dat vykazují minimální aktivitu a nejasnou specifitu.
Úlohou studenta/ky v rámci BP bude příprava a purifikace rekombinantní protilátky BG4 specifické vůči guaninovým kvadruplexům. Její aktivita a specifita bude následně ověřena za využití molekulárně biologických a biofyzikálních metod na přirozených i modelových systémech.
17. 5. 2024 08:17, Mgr. Daniel Renčiuk, Ph.D., učo 183149
Konzultanti
ÚBioch Chem PřF MU
ÚBioch Chem PřF MU
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Strukturní vlastnosti a patologické změny DNA
Mgr. Petra Školáková, Ph.D., učo 151542 -
Vztah mezi primární strukturou a konformací DNA biologicky důležitých oblastí lidského genomu
Mgr. Daniel Renčiuk, Ph.D., učo 183149 -
Antimikrobiální peptidy a jejich vliv na hojení ran.
Mgr. Antonín Pavelka, učo 474499 -
The role of cytosine in the formation of non-canonical DNA structures
Mgr. Esther Peters -
Systematická studie termálních a izotermálních diferenčních spekter čtyřřetězcových struktur nukleových kyselin
Mgr. Veronika Vávrová -
Diverse functions and phase separation properties of RECQ4 helicase N-terminal region
Anna Papageorgiou, Ph.D., MSc -
Vliv pH na stabilitu lektinů
Mgr. Hana Berezňáková -
Strukturní vlastnosti biologicky významných kvadruplexů
MUDr. Markéta Fialová, Ph.D.




