Bakalářská práce

Komprese silového pole na adaptivní mřížce

Force field compression on an adaptive 3D grid

Filip Matiovský, učo 256365
Anotace

Bakalářská práce se zabývá aplikací pro interakci biomolekul vyvíjenou v Laboratoři interakcí člověka s počítačem ve spolupráci s Národním centrem pro výzkum biomolekul a ÚVT MU. Jejím cílem je prostudovat stávající implementace adaptivní prostorové mřížky a komprese silového pole na regulární mřížce a spojit je do jednoho funkčního celku.

Abstract

This thesis deals with application for interacting biomolecules, which is developed in the Laboratory of Human-Computer Interaction in cooperation with the National Center for Biomolecular Research and ÚVT MU. It aims to study the current implementation of adaptive 3-D grid and compression of force field on a regular grid and combine them into one functional unit.

Zadání práce
Pro potřeby aplikace haptické (hmatové) interakce modelů molekul byl vyvinut algoritmus komprese v čase se měnícího třírozměrného silového pole (analogie ke kompresi MPEG videa). Jeho současná implementace pracuje na pravidelné třírozměrné mřížce, přitom se ale ukazuje, že adaptivní změnou rozlišení mřížky lze dosáhnout dalšího výrazného snížení velikosti dat za cenu přijatelné ztráty přesnosti. Implementace komprese a dekomprese silového pole na mřížce proměnlivého rozlišení je tématem několika vzájemně provázaných studentských prací.

Prvním cílem této práce je návrh vhodného formátu souboru pro uložení komprimovaných dat, návrh a implementace knihovny, která bude s takovým souborem pracovat. Dalším cílem je integrace a případné nutné úpravy existujících částí kódu implementujících kompresi do funkčního celku, který ze sekvence souborů obsahujících souřadnice atomů molekuly v jednotlivých snímcích vygeneruje komprimovaný soubor v čase se měnícího silového pole uvedeného formátu.

Předpokládá se základní znalost programování v C/C++ v prostředí Linuxu, detailní znalosti problematiky komprese MPEG ani výpočetní chemie nejsou nezbytné.

Práce zkontrolována:
4. 1. 2012 13:14, Mgr. Aleš Křenek, Ph.D., učo 3086
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
1. 2. 2012
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Aleš Křenek, Ph.D., učo 3086
CUSupp ScColl CERIT-SC ÚVT MU

Oponent

doc. RNDr. Petr Holub, Ph.D., učo 3248
BioMedAI CERIT-SC ÚVT MU

Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Aplikovaná informatika
 
Název
Vložil
Vloženo
Práva
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.