Bakalářská práce

Phylogeny of squirrels (Sciurus, Rodentia) based on supertrees reconstruction

Patrícia Pečnerová, učo 324092
Anotace

Odkedy sa molekulárne dáta využívajú na stanovenie fylogenézy, vrámci skupiny stromových veveríc tribu Sciurini sa pojednáva o mnohých taxonomických nejasnostiach. Pracovala som s rozsiahlym molekulárnym materiálom, aby som stanovila fylogenetické vzťahy a odhalila, kde skupina vznikla. Použila som mitochondriálne a jadrové DNA sekvencie, verejne dostupné, a pomocou Bayesiánskej analýzy a šiestich …více

Abstract

Since molecular data are used to infer phylogeny, many taxonomic ambiguities have been discussed in the group of tree squirrels of the tribe Sciurini. In this study, I worked with extensive published molecular material to establish phylogenetic relationships and discover where the tribe originated. I used mitochondrial and nuclear DNA sequences and through Bayesian analysis and six different methods …více

Zadání práce
Diversity of arboreal squirrels of the genus Sciurus is the greatest in the Neotropic and Nearctic ecozones. Yet, it is believed that squirrels originated in the Palaearctic zone and colonised Americas secondarily. This computational project will attempt to use extensive, but miscellaneous, genetic data available in public databases to reconstruct phylogenetic relationships of squirrels and estimate their origin using modern supertree methods.

REQUIREMENTS: Proficiency in English, interest in computational biology and evolution.
Práce zkontrolována:
11. 5. 2011 06:55, doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D., učo 103641
Plný text práce
1,3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
20. 6. 2011
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Natália Martínková, Ph.D., učo 103641
ÚBZ Biol PřF MU

Oponenti

Autor posudku dosud neidentifikován.
Autor posudku dosud neidentifikován.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.