Diplomová práce

Tolerance poškození DNA genotoxickými komplexy platiny

Tolerance and bypass of DNA damage by genotoxic platinum complexes

Bc. Simona Zahrádková
Anotace

Jedním z mechanismů vedoucích k rezistenci nádorových buněk při léčbě cisplatinou je translézová syntéza (TLS). Tato práce je zaměřena na studium tolerance specifických polymeráz k poškozením DNA, která jsou způsobena analogy cisplatiny obsahujícími enantiomerní diaminové ligandy, cis-[PtCl2(R,R-DAB)] a cis-[PtCl2(S,S-DAB)] (DAB=2,3-diaminobutan). Pozornost je věnována také studiu inkorporací chybného …více

Abstract

One of the mechanisms leading to the resistance of tumor cells to cisplatin is translesion synthesis (TLS). This thesis is focused on the study of specialised TLS polymerases tolerance to DNA damage, caused by cisplatin analogs containing enantiomeric diammine ligands cis-[PtCl2(R,R-DAB)] and cis-[PtCl2(S,S-DAB)] (DAB = 2,3-diamminobutane). Attention is also paid to the study of misincorporations during …více

Zadání práce
Komplexy platiny [PtCl2(DAB)] (DAB = 2,3-diaminobutan) a [PtCl2(DACH)] (DACH = trans-1,2-diaminocyclohexan) patří k cytotoxickým analogům protinádorového léčiva - cisplatiny. Obsahují chirální diaminové ligandy. Enanciomerní páry těchto sloučenin vykazují rozdílné biologické efekty. R,R enanciomer [PtCl2(DACH)] je protinádorově účinnější než S,S enanciomer a S,S enanciomery s DAB i DACH ligandy jsou mutagennější než R,R enanciomery. Oxaliplatina, R,R enanciomer [Pt (oxalát) (DACH)] hraje významnou úlohu v protinádorové terapii, celosvětově se aplikuje v celé řadě nádorových onemocnění, včetně nádorů tlustého střeva, kde jsou cisplatina a její přímé analogy neúčinné. Jejich rozšířená protinádorová aktivita zřejmě souvisí především s velikostí a orientací neodstupujícího (DAB, DACH) ligandu, kdy dochází po vytvoření aduktů na DNA k účinnému zastavení replikativních polymeráz i inhibici transkripce. V procesu rezistence nádorových buněk vůči platinovým chemoterapeutikům hraje významnou úlohu nukleotidová excizní oprava (NER), která vede k vyštěpení vytvořených lézí a translézová syntéza (TLS), kdy dojde k překonání léze v podobě platinového aduktu specializovanými polymerázami. Jsou to především polymerázy ze strukturní rodiny Y: pol. éta, ióta a kappa. Studium tolerance těchto polymeráz k vytvořeným vnitrořetězcovým 1,2-d(GpG) můstkům komplexu R,R a S,S [PtCl2(DAB)] a inkorporace nekomplementárních nukleotidů při TLS by mohlo přispět k vysvětlení rozdílů v biologické aktivitě obou enanciomerů. Zadání práce: 1. Literární rešerše: DNA a její vlastnosti, koordinační komplexy těžkých kovů v protinádorové terapii, komplexy platiny, interakce DNA s komplexy platiny, polymerázy, translézová syntéza, rezistence k platinovým cytostatikům, mutace 2. Příprava templátů v podobě oligonukleotidů se specifickou sekvencí modifikovaných komplexy R,R a S,S [PtCl2(DAB)] a jejich charakterizace (metody: HPLC, EAS, GF AAS, elektroforéza) 3. Studium tolerance polymeráz (TLS) k vytvořeným vnitrořetězcovým 1,2-d(GpG) můstkům komplexu R,R a S,S [PtCl2(DAB)] v zadaných sekvencích a sledování inkorporace nekomplementárních nukleotidů při TLS Jazyk práce: čeština, angličtina Literatura: 1. Malina, J., Novakova, O., Natile, G., Brabec, V. (2012) The Thermodynamics of Translesion DNA Synthesis Past Major Adducts of Enantiomeric Analogues of Antitumor Cisplatin. Chem. Asian J., 7, 1026 - 1031. 2. Malina, J., Novakova, O., Vojtiskova, M., Natile, G. and Brabec, V. (2007) Conformation of DNA GG intrastrand cross-link of antitumor oxaliplatin and its enantiomeric analog. Biophys. J., 93, 3950 – 3962. 3. Novakova, O., Farrell, N.P., Brabec, V. (2017) Translesion DNA synthesis across double-base lesions derived from cross-links of antitumor trinuclear platinum compound: Primer extension, conformational and thermodynamic studies. Matallomics, DOI: 10.1039/x0xx00000x 4. Johnstone, T.C., Suntharalingam, K., Lippard, S.J. (2016) The Next Generation of Platinum Drugs: Targeted Pt(II) Agents, Nanoparticle Delivery, and Pt(IV) Prodrugs. Chem. Rev., 9, 116(5), 3436 - 86. 5. Brown, J.A., Newmister, S.A., Fiala, K.A., Suo, Z. (2008) Mechanism of double-base lesion bypass catalyzed by a Y-family DNA polymerase. Nucleic Acids Res., 36(12), 3867 – 3878. 6. Hubscher, U., Maga, G. Spadari, S. (2002) Eukaryotic DNA Polymerases. Annu. Rev. Biochem., 71, 133 - 63. 7. Chijiwa, S., Masutani, Ch., Hanaoka, F., Iwai, S., Kuraoka, I. (2010) Polymerization by DNA polymerase eta is blocked by cis -diamminedichloroplatinum(II) 1,3-d(GpTpG) cross-link: implications for cytotoxic effects in nucleotide excision repair-negative tumor cells. Carcinogenesis, 31(3), 388 - 393.
Práce zkontrolována:
16. 5. 2019 12:09, doc. Mgr. Olga Nováková, Dr., učo 105537
Plný text práce
6,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
11. 6. 2019
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Olga Nováková, Dr., učo 105537
ÚFKL Fyz PřF MU

Oponent

Hana Kostrhunová
BFÚ AVČR

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.