Bakalářská práce

Vliv prostorové chyby v datech o výskytu druhů na výsledky distribučních modelů

The effect of spatial bias in species occurrence data on the results of species distribution models

Ondřej Macek
Anotace

Modelování rozšíření druhů se v poslední době stalo široce využívaným nástrojem pro studium jejich ekologických nároků, rozsahu potenciálních areálů, či pro účely ochrany přírody. Data o výskytu získávaná z moderních databází jako GBIF však často trpí prostorovým zkreslením, které může negativně ovlivňovat výsledky distribučních modelů. Tato práce zkoumá dopad environmentální filtrace dat, jako jednoho …více

Abstract

Species distribution modeling has recently become a widely used tool for studying species ecological characteristics, their potential distribution ranges or for conservation purposes. However, occurrence data obtained from modern databases such as GBIF often suffer from spatial bias, which can negatively affect the results of distribution models. This thesis examines the impact of environmental filtering …více

Zadání práce
Rozvoj databází o výskytu živých organismů jako je např. Global Information Biodiversity Facility (GBIF) poskytl dostatek údajů pro modelování současného a předpovídání budoucího rozšíření jednotlivých druhů. GBIF je zřejmě největší databází svého druhu, avšak množství údajů z jednotlivých regionů je velmi rozdílné a tak i areály druhů jsou velmi nerovnoměrně pokryté záznamy o jejich lokálním výskytu. Cílem práce je kvantifikovat nejistotu ve výsledcích distribučních modelů s ohledem na různou hustotu záznamů o výskytu druhu v různých částech jeho areálu a zjistit zda lze tuto nejistotu redukovat pomocí filtrace dat. Navržený postup práce bude zahrnovat: 1) výběr několika evropských druhů (ideálně stromů), pro které byla expertně zpracována mapa areálu, a pro které existují vhodná data o výskytu v databázi GBIF (https://www.gbif.org/); 2) vytvoření distribučních modelů na základě a) všech dostupných dat o výskytu druhu a b) dat upravených pomocí vhodné filtrační metody; 3) srovnání modelovaných areálů s expertně zpracovanými mapami a kvantifikaci rozdílů. Výsledky práce by měly objasnit nakolik se jednotlivé modely liší od expertně odhadnutého areálu a zda filtrace dat může tyto modely významně zlepšit.
Literatura:
  • Beck, J., Böller, M., Erhardt, A., & Schwanghart, W. (2014). Spatial bias in the GBIF database and its effect on modeling species’ geographic distributions. Ecological Informatics, 19, 10–15. https://doi.org/10.1016/j.ecoinf.2013.11.002
  • Castellanos, A. A., Huntley, J. W., Voelker, G., & Lawing, A. M. (2019). Environmental filtering improves ecological niche models across multiple scales. Methods in Ecology and Evolution, 10(4), 481–492. https://doi.org/10.1111/2041-210X.13142
  • Caudullo, G., Welk, E., & San-Miguel-Ayanz, J. (2017). Chorological maps for the main European woody species. Data in Brief, 12, 662–666. https://doi.org/10.1016/j.dib.2017.05.007
  • Elith, J., Phillips, S. J., Hastie, T., Dudík, M., Chee, Y. E., & Yates, C. J. (2011). A statistical explanation of MaxEnt for ecologists. Diversity and Distributions, 17(1), 43–57. https://doi.org/10.1111/j.1472-4642.2010.00725.x
  • Fourcade, Y., Engler, J. O., Rödder, D., & Secondi, J. (2014). Mapping Species Distributions with MAXENT Using a Geographically Biased Sample of Presence Data: A Performance Assessment of Methods for Correcting Sampling Bias. PLOS ONE, 9(5), e97122. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0097122
  • Guisan, A., Thuiller, W., & Zimmermann, N. E. (2017). Habitat Suitability and Distribution Models: With Applications in R. Cambridge University Press.
  • Varela, S., Anderson, R. P., García-Valdés, R., & Fernández-González, F. (2014). Environmental filters reduce the effects of sampling bias and improve predictions of ecological niche models. Ecography, 37(11), 1084–1091. https://doi.org/10.1111/j.1600-0587.2013.00441.x
Práce zkontrolována:
19. 5. 2025 09:34, RNDr. Jan Divíšek, Ph.D., učo 106310
Plný text práce
6,3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
25. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Jan Divíšek, Ph.D., učo 106310
GeogÚ VoZ PřF MU

Oponent

Mgr. Martina Sychrová, Ph.D., učo 408249
VyzVeg ÚBZ Biol PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.