Diplomová práce

Konstrukce podvojného vektoru pro genetickou manipulaci a molekulární analýzu bioloužících bakterií

Construction of a shuttle vector for genetic manipulation and molecular analysis of bioleaching bacteria

Bc. Jakub Svinka
Anotace

Acidithiobacillus ferrooxidans je acidofilní chemolitoautotrofní bakterie, která má široké využití jako bioloužicí mikroorganismus v procesu získávání kovů z odpadů. Tato práce si kladla za cíl vytvoření moderního podvojného vektoru pro genetickou manipulaci tohoto bakteriálního druhu. Po jeho úspěšném sestrojení a pomnožení v Escherichia coli jsme vyzkoušeli řadu metod transformace Acidithiobacillus …více

Abstract

Acidithiobacillus ferrooxidans is an acidophilic chemolithoautotrophic bacterium that has a wide range of applications as a bioleaching microorganism in the process of metal recovery from wastes. This work aimed to develop a modern shuttle vector for genetic manipulation of this bacterial species. After its successful construction and propagation in Escherichia coli, we have trialed a number of methods …více

Klíčová slova
Acidithiobacillus bioloužení podvojný vektor transformace elektroporace Yoshidův efekt bioleaching shuttle vector transformation electroporation Yoshida effect
Zadání práce
Metody genetického inženýrství u polyextrémních druhů Acidithiobacillus mají hned několik úskalí a dodnes neexistuje robustní metoda genetické modifikace těchto bakterií, které se využívají při biotechnologické extrakci kovů. Optimalizované metody genetického inženýrství by přinesly řadu výhod jak v základním, tak aplikovaném výzkumu. V nedávné době byl u bakterie At. ferrooxidans CCM 4253 objeven plasmid pAF4253, čehož lze využít při vývoji genetických metod u těchto druhů. Cíle: Konstrukce podvojného vektoru s využitím části sekvence pAF4253 ve spojení s jinými částmi komerčně dostupných vektorů se stabilním selekčním markerem při nízkém pH. Podvojný vektor pak bude možné replikovat nejen v acidofilních Acidithiobacillus spp., ale také v neutrofilní bakterii Escherichia coli. Zároveň bude optimalizována metoda transformace vektoru a selekce pozitivních klonů. Se získaným podvojným vektorem pak budou provedeny pilotní studie genetické manipulace a molekulární analýzy Acidithiobacillus spp., což umožní identifikovat a programovat kmeny vhodné pro biotěžbu kovů.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
11. 1. 2023 11:37, Mgr. Jiří Kučera, Ph.D., učo 67570
Plný text práce
1,7 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
1. 2. 2023
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Jiří Kučera, Ph.D., učo 67570
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

Mgr. Vojtěch Sedláček, Ph.D., učo 21931
ÚBioch Chem PřF MU

Konzultanti

Mgr. Martin Gajdošík
abs PřF MU
doc. Ing. Martin Mandl, CSc., učo 1408
ÚBioch Chem PřF MU

Literatura

  • Acidophiles : life in extremely acidic environments. Edited by Raquel Quatrini - D. Barrie Johnson. Norfolk: Caister Academic Press, 2016, xi, 310. ISBN 9781910190340.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biotechnologie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.