Bakalářská práce

2D virtuální buňka: návrh komponentů a ukázková implementace

2-D virtual cell: component design and sample implementation

Milan Mikuš
Anotace

Práca sa zaoberá možnosťami využitia informácií obsiahnutých v génovej ontológií na vykresľovanie buniek a ich komponentov. Cieľom práce bolo vytvoriť sadu algoritmov, ktoré sa na tento účel budú dať použiť. Zároveň v rámci práce vznikli aj zjednodušené obrazy komponentov bunky. Na základe týchto podkladou vznikla webová aplikácia, zaisťujúca komunikáciu z používateľom.

Abstract

The thesis deals with the possibility to use the information contained within Gene Ontology for drawing views of cells and their components. Aim of this thesis was to create a set of algorithms to be used for this purpose. It also contains simplified cell component drawings. A web application was created, to provide likable user interface for the project.

Klíčová slova
bunka grafové algoritmy Gene Ontology vykreslovanie webová aplikácia spracovanie dát
Zadání práce
Laboratoř SYBILA buduje systém pro automatickou 2D vizualizaci buněčných procesů. K jejich realizaci je potřeba vizualizovat i samotné buňky nebo jejich části. Úkolem studenta bude za pomoci ontologie buněčných komponentů (GeneOntology) a učebnic biologie navrhnout spoločně se školitem algoritmus, který nalezne ideální způsob vykreslení struktury buňky. Ten následně implementuje. Součástí práce bude i jednoduchá sbírka graficky zpracovaných komponentů potřebných pro tento typ vizualizací. Vytvoří definice v SVG, nebo jiném vhodném jazyce pro jednotně působící dvourozměrné komponenty. Na jednoduchém příkladu demonstruje jejich využití ve vytvořeném programu pro automatické generování 2D pohledů na buněčné systémy.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
19. 5. 2015 09:03, doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D., učo 31298
Plný text práce
1,6 MB / soubor PDF
Přílohy (1)
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
19. 6. 2015
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D., učo 31298
KSUZD FI MU

Oponent

doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D., učo 3159
KSUZD FI MU

Literatura

  • ALBERTS, Bruce. Essential cell biology. 2nd ed. New York: Garland science, 2004, xxi, 740. ISBN 0815334818.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Fakulta informatiky
Studijní program
Aplikovaná informatika
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.