Diplomová práce

Analysis of seminal plasma microbiome

Jan Hofman, učo 508551
Anotace

Díky rychlému rozvoji mikrobiomového výzkumu je dnes možné čerpat z rostoucího počtu rozsáhlých meta-analýz i experimentálních studií, které poukazují na úzkou souvislost mezi seminálním mikrobiomem a parametry spermiogramu, a tím i s mužskou fertilitou. V rámci této diplomové práce jsme se na základě literární rešerše zaměřili na problematiku seminálního mikrobiomu, konkrétně bakteriomu, tedy veškeré …více

Abstract

Thanks to the rapid advancements in microbiome research, an increasing number of large-scale meta-analyses and experimental studies have highlighted a close relationship between the seminal microbiome and semen analysis parameters, and thus male fertility. In this thesis, we focused—based on an extensive literature review—on the seminal microbiome, specifically the bacteriome, defined as the total …více

Zadání práce
V etiopatogenezi celé řady onemocnění urogenitálního traktu u mužů, včetně snížené fertility, hraje roli mikrobiota osidlující tuto lokalitu. Z meta-analýzy zaměřených na mikrobiotu seminální plazmy vyplývá, že specifické bakterie a složení bakteriomu v této matrici může mít negativní vliv na kvalitu spermií. Metodicky je analýza mikrobiomu, tedy mikrobiální DNA, v seminální plazmě výzvou a dosud neexistují doporučení pro její zpracování, aby výsledky analýz mohly být korektně porovnatelné mezi studiemi. Hlavním cílem diplomové práce je zavést metodiku analýzy bakteriomu, příp. mykobiomu, seminální plazmy v rámci pilotní studie, mezi dílčí cíle patří: sepsání rešerše zaměřená na metodiku analýzy mikrobiomu seminální plazmy, příprava protokolu pro zpracování seminální tekutiny před metagenomickou analýzou, podíl na designu pilotní studie a náboru účastníků do pilotní studie, vyšetření kvality spermatu s odborným konzultantem, analýza vzorků pomocí 16S (případně ITS) rRNA sekvenování a vyhodnocení dat.
Kontrola práce vedoucím nebo pověřenou osobou dosud neprovedena.

Upozornění:

Část závěrečné práce byla v souladu s § 47b zákona o vysokých školách skryta z důvodu překážky pro její zveřejnění do 18. 4. 2028.

Odůvodnění: Skrytí části závěrečné práce (metodiky, výsledků a diskuze) je v souladu s platnou legislativou a vnitřními předpisy LF MU a je řádně zdůvodněno s ohledem na plánované využití výsledků výzkumu realizovaného v rámci zpracování práce. Výsledky práce budou využity pro publikování vědeckého článku, přičemž je nezbytné dočasně nezveřejnit informace o metodologickém přístupu vyvíjeném ve spolupráci s RECETOXem.

Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
2. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Petra Bořilová Linhartová, Ph.D., MBA, učo 106107
Environ EnvEpi RECETOX PřF MU

Oponent

doc. Ing. Michal Ješeta, Ph.D., učo 118226
ÚHE Teorie LF MU

Konzultant

Mgr. Petra Brenerová, Ph.D., učo 151178
MicroBiom CentLab RECETOX PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.