Diplomová práce

Studium struktury a funkce 1c ABD domény myšího Plektinu

Structural and functional study of 1cABD domain of mouse Plectin

Bc. Zuzana Máčalová
Anotace

Plektin je významný cytoskeletální protein, jehož absence vede ke vzniku geneticky podmíněné nemoci epidermolysis bullosa simplex, též známá jako nemoc motýlích křídel. Díky své vysoké variabilitě a funkční flexibilitě je plektin mimo kůži exprimován i v dalších tkáních a buněčných typech. Jedna z jeho isoforem, plektin 1c, je ve vysokém množství exprimován v nervových buňkách a postsynaptických dendritech …více

Abstract

Plectin is a significant cytoskeletal protein. Its absence leads to the development of a genetic condition epidermolysis bullosa simplex, also known as butterfly disease. Due to plectin‘s high variability and functional flexibility, except for the skin plectin is expressed in other tissues and cellular types. One of its isoform, plectin 1c, is in large amounts expressed in nerve cells and postsynaptic …více

Zadání práce
Plektin je protein s multidoménovou strukturou, jehož N-koncové aktin vazebné doméně (ABD) předchází variabilní sekvence, která je kódovaná různými prvními exony (1, 1a-1g). Vlastní ABD doména obsahuje dvě alternativní sekvence uvnitř domény označované jako 2alpha a 3alpha. Tyto alternativně sestřihované sekvence vytvářejí překvapivou rozmanitost tohoto cytoskeletálního proteinu, což má podstatný vliv i na jeho strukturu a funkci. K objasnění strukturálních změn způsobených těmito sekvenčními změnami může sloužit nám dostupná analytická metoda-nukleární magnetická rezonance (NMR). Tato metoda je rozvíjena na našem pracovišti a je vhodná pro studium biomolekul z několika důvodů. Umožňuje studium malých proteinů v atomárním rozlišení, měření probíhá v roztoku, což dovoluje sledovat jejich chování, dynamiku a interakce s jinými molekulami. Cílem diplomové práce bude připravit dvě různé varianty ABD domény ke strukturní analýze a pomocí dostupných analytických metod se pokusit změřit rozdíly v interakci k vybraným proteinům (tubulin, aktin).
Práce zkontrolována:
15. 5. 2017 08:48, RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793
Plný text práce
4,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
8. 6. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793
ext NCBR PřF MU

Oponent

RNDr. Lubomír Janda, Ph.D., učo 96793

Konzultant

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D., učo 38990
BNMRS CSB CEITEC MU

Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.