Bakalářská práce

Mapování výskytu zlomů a objemných DNA lézí u mutantů histonových chaperonů Arabidopsis thaliana

Mapping the frequency and persistence of breaks and bulky DNA lesions in histone chaperone mutants of Arabidopsis thaliana

Karolina Vašková
Anotace

Tato bakalářská práce se zabývá studiem histonového chaperonu CAF1 (Chromatin Assembly factor 1) u modelové rostliny Arabidopsis thaliana. Cílem je prohloubit znalosti o jeho konkrétních funkcích v procesech reparace DNA. Zjištění mechanismů, kterými se chaperony podílí na opravách poškozené DNA, může v budoucnu vést k rychlejšímu vývoji geneticky upravených potravin, případně později pomoci s léčbou …více

Abstract

This bachelor thesis deals with the study of the histone chaperone CAF1 (Chromatin Assembly factor 1) in Arabidopsis thaliana. The goal is to deepen knowledge about its specific functions in DNA repair processes. The discovery of the mechanisms by which chaperones are involved in the repair of damaged DNA may lead to faster development of genetically modified foods or help with the treatment of diseases …více

Zadání práce

Rostliny jsou konstantně vystaveny environmentálním a chemickým faktorům, které způsobují široké spektrum poškození DNA, od jednoduchých modifikací bází (oxidace guaninu) po složitější kovalentní adukty typu protein-DNA, až po komplexní léze včetně cyklopyrimidinových dimerů a jednovláknových a dvouvláknových zlomů. I když základní mechanismy oprav u rostlin jsou známy, remodelace chromatinu, která je nezbytná pro rekonstrukci chromatinového templátu v průběhu oprav, a dynamika opravy poškození jsou málo studovanými aspekty reparace DNA. S využitím dobře charakterizovaných mutantů Arabidopsis thaliana bude cílem bakalářské práce objasnit, jestli se frekvence vzniku a následné opravy různých typů poškození liší v důsledku dysfunkce histonového chaperonového komplexu CAF-1. Analýza se zaměří především na detekci lézí způsobených ozářením UV světlem. Z experimentálního hlediska bude kladen důraz na základní postupy práce s rostlinným materiálem (genotypizace mutantů, kultivace rostlin), rutinní i pokročilé mikroskopické metody včetně konfokální mikroskopie a biochemické techniky pro analýzu poškození DNA (dot-blot analýza 8-oxodG modifikací a cyklopyrimidinových dimerů pomocí specifických protilátek).

Práce zkontrolována:
17. 5. 2024 08:25, Mgr. Martina Nešpor Dadejová, Ph.D., učo 53382
Plný text práce
1,5 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
27. 6. 2024
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Martina Nešpor Dadejová, Ph.D., učo 53382
MKChr MCGPR CEITEC MU

Oponent

RNDr. Jan Skalák, Ph.D., učo 269813
FGPR MCGPR CEITEC MU

Konzultant

Mgr. Michal Franek, Ph.D., učo 357550
MKChr MCGPR CEITEC MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.