Závěrečná práce: Karolina Vašková: Mapování výskytu zlomů a objemných DNA lézí u mutantů histonových chaperonů Arabidopsis thaliana
Bakalářská práce
Mapování výskytu zlomů a objemných DNA lézí u mutantů histonových chaperonů Arabidopsis thaliana
Mapping the frequency and persistence of breaks and bulky DNA lesions in histone chaperone mutants of Arabidopsis thaliana
Anotace
Tato bakalářská práce se zabývá studiem histonového chaperonu CAF1 (Chromatin Assembly factor 1) u modelové rostliny Arabidopsis thaliana. Cílem je prohloubit znalosti o jeho konkrétních funkcích v procesech reparace DNA. Zjištění mechanismů, kterými se chaperony podílí na opravách poškozené DNA, může v budoucnu vést k rychlejšímu vývoji geneticky upravených potravin, případně později pomoci s léčbou …více
Abstract
This bachelor thesis deals with the study of the histone chaperone CAF1 (Chromatin Assembly factor 1) in Arabidopsis thaliana. The goal is to deepen knowledge about its specific functions in DNA repair processes. The discovery of the mechanisms by which chaperones are involved in the repair of damaged DNA may lead to faster development of genetically modified foods or help with the treatment of diseases …více
Zadání práce
Rostliny jsou konstantně vystaveny environmentálním a chemickým faktorům, které způsobují široké spektrum poškození DNA, od jednoduchých modifikací bází (oxidace guaninu) po složitější kovalentní adukty typu protein-DNA, až po komplexní léze včetně cyklopyrimidinových dimerů a jednovláknových a dvouvláknových zlomů. I když základní mechanismy oprav u rostlin jsou známy, remodelace chromatinu, která je nezbytná pro rekonstrukci chromatinového templátu v průběhu oprav, a dynamika opravy poškození jsou málo studovanými aspekty reparace DNA. S využitím dobře charakterizovaných mutantů Arabidopsis thaliana bude cílem bakalářské práce objasnit, jestli se frekvence vzniku a následné opravy různých typů poškození liší v důsledku dysfunkce histonového chaperonového komplexu CAF-1. Analýza se zaměří především na detekci lézí způsobených ozářením UV světlem. Z experimentálního hlediska bude kladen důraz na základní postupy práce s rostlinným materiálem (genotypizace mutantů, kultivace rostlin), rutinní i pokročilé mikroskopické metody včetně konfokální mikroskopie a biochemické techniky pro analýzu poškození DNA (dot-blot analýza 8-oxodG modifikací a cyklopyrimidinových dimerů pomocí specifických protilátek).
17. 5. 2024 08:25, Mgr. Martina Nešpor Dadejová, Ph.D., učo 53382
Konzultant
Citace dle normy ČSN ISO 690
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Vliv činidel způsobujících poškození DNA na reparační procesy u mutantů A. thaliana
Mgr. Zuzana Fusková -
Studium a charakterizace interakcí histonových chaperonů u Arabidopsis thaliana
Mgr. Lenka Ptáčníková -
Studium struktury chromatinu u Arabidopsis mutant pro chromatin remodelující faktory
Mgr. Karolína Kolářová -
Dynamika oprav DNA u lidských kmenových buněk
Mgr. Renata Hejnová -
Crossroads of genetics and epigenetics: nucleosome assembly and chromosome integrity
Mgr. Karin Jaške, Ph.D. -
Interakční dráhy proteinů asociovaných s chromatinem během opravy DNA
Mgr. Adéla Machelová, Ph.D., učo 423599 -
Analýza DNA reparačních procesů u A.thaliana
Mgr. Adéla Machelová, Ph.D., učo 423599 -
Mechanismy oprav DNA studované metodami pokročilé konfokální mikroskopie
Mgr. Jana Suchánková, Ph.D., učo 323947




