Diplomová práce

Charakterizace nového druhu stafylokokového bakteriofága čeledi Podoviridae

Characterization of a novel staphylococcal bacteriophage of the Podoviridae family

Jiřina Havránková
Anotace

Rezistence bakterií rodu Staphylococcus vůči antibiotikům je vážným celosvětovým problémem. Druh Staphylococcus sciuri je spíše komenzálním druhem, avšak jeho výskyt koreluje s výskytem některých onemocnění u člověka i hospodářských zvířat. Stejně jako jiné bakterie, je i tento druh hostitelem bakteriálních virů. Cílem této práce byla detailní charakterizace nového podoviru S. sciuri s10. Ten je unikátní …více

Abstract

Antibiotic resistance of the genus Staphylococcus is a serious worldwide problem. Staphylococcus sciuri is rather a commensal species, but its occurrence correlates with emergence of some human and animal diseases. Like other bacteria, this species is a host of bacterial viruses. The aim of this thesis was to characterize the novel podovirus S. sciuri s10. The bacteriophage is unique in terms of its …více

Zadání práce
Bakteriofágy s aplikačním využitím jsou běžně izolovány z odpadních vod. Stejným způsobem byl zachycen nový typ stafylokokového podoviru s větší, dosud nepozorovanou, strukturou bičíku ("tail knob"), která se účastní přenosu fágového genomu přes buněčnou stěnu. Předmětem práce bude kompletní molekulárně biologická a mikrobiologická charakterizace fága zahrnující genomickou a proteomickou charakterizaci, charakterizaci rozmezí hostitele a růstové vlastnosti fága, optimalizace metod pro purifikaci fága a příprava materiálu pro strukturní studie, charakterizace lytických proteinů fága včetně klonování a exprese lytických proteinů a jejich charakterizaci.

Literatura
Staphylococcus sciuri bacteriophages double-convert for staphylokinase and phospholipase, mediate interspecies plasmid transduction, and package mecA gene. Zeman M, Mašlaňová I, Indráková A, Šiborová M, Mikulášek K, Bendíčková K, Plevka P, Vrbovská V, Zdráhal Z, Doškař J, Pantůček R. Scientific Reports 2017; 7:e46319, doi: 10.1038/srep46319.

Application of bacteriophages. Aminov R, Caplin J, Chanishvili N, Coffey A, Cooper I, De Vos D, Doškař J, Friman V-P, Kurtböke I, Pantůček R, Pirnay J-P, Resch G, Rohde C, Sybesma W, Wittmann J. Microbiology Australia 2017; 38(2):63-66.

Structure and genome release of Twort-like Myoviridae phage with a double-layered baseplate. Nováček J, Šiborová M, Benešík M, Pantůček R, Doškař J, Plevka P. Proceedings of the National Academy of Sciences 2016; 113(33):9351–9356.

Genetically modified bacteriophages in applied microbiology. Bárdy P, Pantůček R, Benešík M, Doškař J. Journal of Applied Microbiology 2016; 121(3):618–633.

Complete nucleotide sequence and molecular characterization of two lytic Staphylococcus aureus phages: 44AHJD and P68. Vybiral D, Takác M, Loessner M, Witte A, von Ahsen U, Bläsi U. FEMS Microbiol Lett. 2003: 28;219(2):275-83.

Complete genome analysis of two new bacteriophages isolated from impetigo strains of Staphylococcus aureus. Botka T, Růžičková V, Konečná H, Pantůček R, Rychlík I, Zdráhal Z, Petráš P, Doškař J. Virus Genes 2015; 51(1):122-131. doi:10.1007/s11262-015-1223-8.
Práce zkontrolována:
1. 8. 2020 08:00, Mgr. Tibor Botka, Ph.D., učo 177238
Plný text práce
2,7 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
10. 9. 2020
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Tibor Botka, Ph.D., učo 177238
ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Dominik Hrebík, Ph.D., učo 376324
StrvIR CSB CEITEC MU

Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.