Metoda průtokové cytometrie umožňuje kvantitativně i kvalitativně charakterizovat vlastnosti částic i jednotlivých buněk za pomocí průchodu laserovým paprskem. Lze tak pozorovat buněčný cyklus, apoptózu nebo třídit buňky podle určitých znaků. V současné době se metoda často využívá například v biochemii, imunulogii nebo klinické mikrobiologii. Cílem práce bude formou literární rešerše přehledně zpracovat i) základní principy metodiky a přehled nejnovějších trendů u aktuálně nabízených systémů, ii) možnosti využití v klinické a výzkumné mikrobiologii a virologii, iii) problematiku fluorescenčního barvení a jeho využití v průtokové cytometrii bakterií a virů.