Diplomová práce

Charakteristika vazby nádorových supresorů na strukturní motivy DNA

Binding characteristics of tumor suppressor genes to DNA structural motifs

Bc. Gabriela Bučeková, učo 436961
Anotace

Protein p53 patří mezi jednu z nejdůležitějších molekul v lidském těle. Nádorový supresor p53 jako transkripční faktor v buňce reguluje množství dějů, například opravu DNA, zastavení buněčného cyklu či indukci apoptózy. Mutace v genu TP53, který kóduje tento protein, jsou spojeny se vznikem různých typů nádorového onemocnění. Funkci nádorového supresoru může p53 plnit hlavně díky jeho schopnosti vázat …více

Abstract

Tumor suppressor p53 is one of the most important molecule in the human body. As a transcription factor, p53 regulates several cellular processes such as DNA repair, cell cycle or induction of apoptosis. Mutations in TP53 gene, the gene encoding p53, are generally associated with tumorigenesis. DNA binding ability of p53 is one of the main mechanism to suppress cancer cell growth. P53 has two DNA-binding …více

Klíčová slova
proteín p53 izoformy p53 nádorový supresor vazba proteín-DNA lokální struktury křížová struktura G-kvadruplex EMSA AFM P53 protein p53 isoforms tumor suppressor protein-DNA binding secondary structure cruciform structure G-quadruplex
Zadání práce
Nádorové supresory hrají důležitou úlohu v ochraně buňky před rakovinovým bujněním. U celé řady těchto proteinů je zprostředkována jejich funkce přes protein-protein a protein–DNA interakce. Bylo prokázáno, že např. proteiny (BRCA1, rodina p53, IFI16) se vážou s preferencí na lokální struktury v DNA. Tvorba různých forem DNA je významnou regulační součástí buňky. V této diplomové práci bude student analyzovat preferenci vazby protein-DNA pomocí gelové retardační analýzy (EMSA) a oligomerní stav proteinů při vazbě na různé strukturní motivy DNA (jednořetězcová, dvouřetězcová DNA, triplex, kvadruplex, krížová forma) pomocí silové rastrovací mikroskopie (AFM). Je vyžadována aktivní účast studenta na plánování a realizaci experimentů s pravidelnou docházkou do laboratoře. Student se bude podílet na projektech řešených na pracovišti školitele.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
7. 1. 2020 08:10, prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D., učo 15548
Plný text práce
2,6 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
4. 2. 2020
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D., učo 15548
AnatÚ Teorie LF MU

Oponent

Mgr. Markéta Pernisová, Ph.D., učo 11554
NCBR PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.