Master's thesis

Effect of experimental conditions on the quality of proteomic analysis

Vliv experimentálních podmínek na kvalitu proteomické analýzy

Bc. Maxmilián Vlk
Abstract

Diplomová práce se zabývá vlivem experimentálních podmínek kapalinové chromatografie na kvalitu proteomické analýzy s hmotnostní detekcí. Teoretická část shrnuje principy bottom-up proteomiky, roli spojení kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie (LC-MS), retenční chování peptidů v systému reverzních fází a možnosti využití retenčních modelů při optimalizaci LC separace. Pozornost je věnována …more

Abstract

The presented diploma thesis investigates the influence of liquid chromatography experimental conditions on the quality of bottom-up proteomic analysis of peptides via mass spectrometry. The theoretical part summarizes the principles of bottom-up proteomics, the role of liquid chromatography coupled to mass spectrometry (LC-MS), peptide retention in reversed-phase liquid chromatography, and the use …more

Keywords
bottom-up hmotnostní spektrometrie kapacita separace kapalinová chromatografie model lineární síly rozpouštědla proteomická analýza retenční modelování linear solvent strength model liquid chromatography mass spectrometry peak capacity proteomic analysis retention modelling
Thesis description
  1. Vypracujte literární rešerši týkající se využití retenčních modelů v proteomické analýze, zaměřte se na hodnocení kvality chromatografické a proteomické analýzy.
  2. S využitím standardního vzorku peptidů charakterizujte kinetické vlastnosti komerčně dostupných kolon, zaměřte se na typ kolony a vliv teploty analýzy.
  3. Vytvořte skript využívající získaná experimentální data k charakterizaci kolon.  
  4. Na vybrané koloně porovnejte chromatografické charakteristiky s informacemi získanými pomocí proteomických vzorků.  
  5. Výsledky kriticky zhodnoťte a prezentujte formou přehledných tabulek a grafů.
Administrative information
The thesis has been checked:
17/5/2026 20:04, prof. RNDr. Jiří Urban, Ph.D., UČO 240583
Full text of thesis
1,3 MB / file PDF
Language used
Czech Czech
Defence date
10/6/2026
The thesis was defended successfully

Supervisor

prof. RNDr. Jiří Urban, Ph.D., UČO 240583
ÚChem Chem PřF MU

Reader

doc. Mgr. Jan Havliš, Dr., UČO 743
NCBR PřF MU

Consultant

Mgr. Jan Valášek
ÚChem Chem PřF MU
Cite this text
Masaryk University Faculty of Science
Programme
Plan
Analytical Chemistry

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.

Similar documents

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.