Diplomová práce

Optimalizace kinetiky separace v proteomické analýze

Optimization of separation kinetics in proteomic analysis

Bc. Lukáš Hekerle
Anotace

Tato diplomová práce se zabývá vývojem a optimalizací LC-MS/MS metody v proteomické analýze. Cílem práce je nalezení optimálních chromatografických podmínek (průtok mobilní fáze, teplota, rozsah gradientu a čas separace) pro kvalitní analýzu komplexních proteomických vzorků. V prvním kroku bude porovnáno sedm chromatografických kolon z hlediska jejich separační účinnosti za pomoci grafů kinetické účinnosti …více

Abstract

Presented diploma thesis is aimed to a development and optimization of LC-MS/MS method suitable for proteomic analysis. First, seven reversed-phase columns are compared with respect to their separation efficiency through kinetic plots. Afterwards, the optimal conditions of mobile phase flow rate, column temperature, and gradient profile are utilized on an optimal chromatographic column. In the end, the analysis of complex proteomic sample under optimal conditions is performed.

Klíčová slova
gradientová eluce hmotnostní spektrometrie HPLC kapacita separace kinetické grafy optimalizace proteomická analýza gradient elution kinetic plots mass spectrometry optimization peak capacity proteomics
Zadání práce

1) Vypracujte literární rešerši týkající se optimalizace gradientové eluce peptidů a využití grafů kinetických závislostí v charakterizaci analýzy.

2) Charakterizujte kinetické vlastnosti chromatografických kolon v separaci modelového vzorku peptidů, porovnejte různé experimentální podmínky (čas gradientu, teplota analýzy, průtok mobilní fáze).

3) Vyberte optimální kolonu a odpovídající experimentální podmínky.

4) Využijte optimální podmínky v analýze složitějších proteomických vzorků.

5) Výsledky přehledně zpracujte a kriticky zhodnoťte.

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
16. 6. 2021 07:39, prof. RNDr. Jiří Urban, Ph.D., učo 240583
Plný text práce
2 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
30. 6. 2021
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Jiří Urban, Ph.D., učo 240583
ÚChem Chem PřF MU

Oponent

doc. Mgr. Jan Havliš, Dr., učo 743
NCBR PřF MU

Konzultant

Ing. Martina Nechvátalová, Ph.D., učo 478963
ÚChem Chem PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Analytická chemie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.