Diplomová práce

Optimalizace spojení mikrokolonové LC-MS v proteomické analýze

Microflow LC-MS optimization in proteomics analysis

Bc. Jan Valášek
Anotace

Spojení kapalinové chromatografie s hmotnostní spektrometrií (LC-MS) se stalo jednou ze základních metod v proteomické analýze. Pro svou vysokou citlivost se tak LC-MS pracující především v oblastech nanolitrových průtoků (nano LC-MS) stalo zlatým standardem pro výzkum proteinových modifikací, komplexních biologických vzorků i celých proteomů. Kvůli nízké robustnosti nano LC-MS a s tím spojenou obtížnou …více

Abstract

The hyphenation of liquid chromatography with mass spectrometry (LC-MS) has become one of the fundamental methods in proteomics. Due to its high sensitivity, nano LC-MS has become the gold standard for studying protein modifications, complex biological samples, and entire proteomes. Due to the low robustness of nano LC-MS and the associated difficulty of application in clinical analysis, attention …více

Klíčová slova
proteomická analýza LC-MS optimalizace matematické plánování necílová analýza proteomics optimization Design of Experiments shotgun analysis
Zadání práce
  • 1) Vypracujte literární rešerši zabývající se využitím mikrokolonové kapalinové chromatografie v proteomické analýze. Zaměřte se také na postupy matematického plánování.
  • 2) S využitím modelového vzorku postupně optimalizujte jednotlivé kroky spojení mikrokolonové LC-MS. Zaměřte se zejména na možnosti zvýšení citlivosti a počet identifikovaných peptidů.
  • 3) Vybrané optimální podmínky využijte při analýze komplexního proteomického vzorku.
  • 4) Výsledky přehledně zpracujte a kriticky zhodnoťte.
    • Administrativní informace
    Práce zkontrolována:
    18. 5. 2023 11:34, prof. RNDr. Jiří Urban, Ph.D., učo 240583
    Plný text práce
    2,9 MB / soubor PDF
    Jazyk práce
    čeština čeština
    Termín obhajoby
    6. 6. 2023
    Práce byla úspěšně obhájena

    Vedoucí

    prof. RNDr. Jiří Urban, Ph.D., učo 240583
    ÚChem Chem PřF MU

    Oponent

    doc. Mgr. Jan Havliš, Dr., učo 743
    NCBR PřF MU

    Konzultant

    Mgr. Antonín Bednařík, Ph.D., učo 175475
    ÚChem Chem PřF MU
    Citovat tuto práci
    Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
    Studijní program
    Plán
    Analytická chemie

    Práce na příbuzné téma

    Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

    Podobné práce

    • Přidání souboru

      Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

    • Další operace se soubory

      Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

    • Pohled pro experty

      Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

    • Vyhledávání souborů

      Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

    • Rychlý přístup k souborům

      Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.