Rostliny nedisponují stejným imunitním systémem jako živočichové, jsou však schopné se bránit řadě potenciálních patogenů. Obranyschopnost je založena na aktivní odpovědi rostliny na útok patogenu. Tato aktivní obranná reakce velmi často kulminuje tzv. hypersenzitivní reakcí (HR), ve které se rostlinné buňky brání průniku patogenu svou vlastní nekrózou. V dalších fázích je aktivována celá řada fyziologických procesů, které chrání rostliny před onemocněním. Dochází například ke zpevňování buněčné stěny rostliny, tvorbě fytoalexinů a PR-proteinů (pathogen related proteins) a aktivaci obranných genů. Mezi PR proteiny patří například enzymy degradující buněčnou stěnu hub, antimikrobiální polypeptidy nebo komponenty signální kaskády obranné reakce. Některé PR-proteiny (glukanasy a chitinasy) a fytoalexiny jsou schopny přímo zabíjet patogen nebo alespoň zabránit jeho dalšímu růstu. Vznik obranné reakce může za určitých okolností vést ke vzniku systémové rezistence (SAR). PR proteiny jsou produkovány během několika hodin jako odpověď rostlin na infekci, případně abiotický stres. Jedná se většinou o monomery s nízkou molekulovou hmotností (8-50 kDa), jsou stabilní za různých fyzikálně chemických podmínek a relativně rezistentní vůči působení proteolytických enzymů. Kyselé PR proteiny (jejich isoelektrický bod je v kyselé oblasti) se vyskytují extracelulárně, bazické (s isoelektrickým bodem v bazické oblasti) jsou vakuolární. Na základě primárních sekvencí a biologických aktivit se PR proteiny dělí do tříd, dosud bylo identifikováno 17 tříd PR proteinů, které se vyskytují ve většině rostlinných druhů. Kromě PR proteinů hrají v obranné reakci klíčovou roli také produkty tzv. obraných genů jako například phenylalaninamoniaklyasa, epi-aristolochensynthasa, NADPHoxidasa a lipooxygenasa. Doktorand/ka se bude zabývat proteomickými studiemi obranné reakce vyvolané různými elicitory (ergosterol, elicitiny a mutantním elicitiny). Cílem bude charakterizovat odlišnosti ve spektru proteinů účastnících se obranné reakce v závislosti na použitém elicitoru.