Multimodální a funkční zobrazovací laboratoř (MAFIL) je jedním z klíčových zařízení ve společnosti CEITEC MUNI a součástí velké národní výzkumné infrastruktury Czech-BioImaging a evropské výzkumné infrastruktury Euro-BioImaging. Hlavní úlohou je zajištění přístupu k lékařským zobrazovacím technologiím – především zobrazování magnetickou rezonancí doprovázené různými elektrofyziologickými metodami.

Cílem práce je podpořit implementaci změn pracovního workflow laboratoře pro zpracování neuromedicínských obrazových dat a metadat tak, aby se řídilo zásadami FAIR a (meta)data byla připravena k publikování a cloudovému zpracování v EOSC. Jedním z úkolů je nalezení optimálních postupů anonymizace neuromedicínských obrazových dat, které umožní jejich snadnější sdílení, ale přitom anonymizací nedojde k zásadnímu poškození informační hodnoty obrazů z hlediska jejich výzkumného zpracování.

V rámci práce tedy budou prozkoumány a vyzkoušeny různé možnosti anonymizace neuromedicínských obrazových dat a vyhodnocen vliv daných anonymizačních postupů na kvalitu anonymizovaných obrazů z hlediska jejich dalšího výzkumného zpracování. Na základě vyhodnocení bude navržen optimální postup anonymizace takových dat v rámci MAFIL laboratoře.

Technicky jsou preferovány samostatné nástroje (nejlépe v jazyce Python/MATLAB) umožňující zpracování obrazových dat (NIfTI) ve standardizovaném formátu (BIDS). Pro vyhodnocení a dokumentaci výsledků je preferováno použití nástrojů MATLAB, R, JupyterLab apod. Pro práci na projektu zajistí MAFIL přístup ke specializovanému software (MATLAB, ...).