Diplomová práce

Analýza alternativního sestřihu genu STAT3

Analysis of alternative splicing of STAT3 gene

Bc. Michal Kramárek, učo 375732
Anotace

Alternativní sestřih pre-mRNA umožňuje tvorbu vícero mRNA z jediného transkriptu, čímž rozšiřuje variabilitu lidského proteómu. Důležitost alternativního sestřihu u člověka je podpořená faktem, že 95% až 100% všech genů vytváří alespoň dvě různé mRNA. V této práci se zabývám alternativním sestřihem tandemového 5‘ místa sestřihu v exonu 21 genu STAT3. V práci byly využity in silico predikce a mutace …více

Abstract

Alternative splicing of pre-mRNA allows formation of several mRNAs from a single transcript. This also expands variability of a human proteome. Importance of alternative splicing in human is supported by the fact that 95% - 100% of all genes produce at least two mRNAs. In this thesis I deal with alternative splicing of tandem 5‘splice site in exon 21 of STAT3 gene. This thesis uses in silico predictions …více

Klíčová slova
alternativní sestřih pre-mRNA tandemové 5’ místo sestřihu STAT3 posunutá vazba U1 snRNA U6 snRNA alternative splicing of pre-mRNA tandem 5’ splice site shifted pairing of U1 snRNA
Zadání práce
STAT3 je transkripční faktor, který je součástí JAK/STAT signální dráhy. Již dříve bylo popsáno několik sestřihových variant transkriptu STAT3 u člověka. Alternativní sestřih v exonu 21 genu STAT3 vede ke tvorbě dvou transkriptů, z nichž jeden využívá donorové místo sestřihu lokalizované o 3 nukleotidy směrem do exonu ve srovnání s druhým transkriptem. Samotná sekvenční struktura rozhraní exonu 21 a následujícího intronu 21 pravděpodobně zodpovídá za využití obou sestřihových míst. Cílem diplomové práce bude přispět k objasnění molekulární podstaty alternativního sestřihu exonu 21 genu STAT3. K tomu bude využito kombinovaného přístupu spojujícího in silico predikce a in vivo studie ověřující vliv mutací donorového sestřihového místa na tvorbu obou transkriptů.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
11. 5. 2016 11:12, Mgr. Přemysl Souček, Ph.D., učo 21156
Plný text práce
1,9 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
6. 6. 2016
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Přemysl Souček, Ph.D., učo 21156
Pracoviště výzkumu genomu Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Experimentální biologie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.