Diplomová práce

Rozpoznání DNA modifikované fluorescenčními značkami a reaktivními funkčními skupinami specifickými proteiny

Recognition of DNA modified with fluorescent labels or reactive functional groups by specific proteins

Bc. Martin Langer
Anotace

Fluorescenční metody obecně představují efektivní způsob studia biologických procesů. Terminální fluorescenční značení DNA patří k běžným technikám využívaným pro sledování DNA-protein interakcí. Naproti tomu nový potenciál pro sledování těchto interakcí nabízí cílená příprava DNA modifikované vhodnými fluorescenčními značkami. V rámci diplomové práce byly připraveny specifické modifikované DNA, a …více

Abstract

Fluorescence methods generally represent an effective way to study biological processes. Terminal fluorescent labeling of DNA is one of the conventional techniques used for monitoring protein-DNA interactions. On the other hand, there is a potential for monitoring these interactions offered by methodic approaches of targeted synthesis of DNA modified by suitable fluorescent labels. Within this thesis …více

Klíčová slova
Fluorescenční próby protein p53 solvatochromní fluorofory molekulární rotory
Zadání práce
Chemicky modifikovaná DNA je osvědčeným nástrojem studia nukleotidových sekvencí a různých interakci DNA s dalšími molekulami, včetně proteinů vázajících se na DNA s různou mírou specificity k její nukleotidové sekvenci či konformaci. V naší laboratoři se zabýváme studiem modifikace DNA různými chemickými skupinami, včetně elektrochemicky aktivních značek, fluoroforů a reaktivních skupin umožňujících vytvoření kovalentní vazby s další molekulou. Aby byly modifikované DNA sondy prakticky využitelné v bioanalytických metodách a biosenzorech, je nutné mít podrobné znalosti o tom, jak daná modifikace ovlivňuje příslušnou DNA-protein interakci, zda nedochází ke ztrátě rozpoznání specifické sekvence či zda naopak příslušná modifikace nezvyšuje afinitu proteinu k nespecifické sekvenci DNA. V rámci tohoto tématu budou detailně testovány interakce nádorových supresorů rodiny p53 s DNA modifikovanou některými v nedávné době zavedenými fluorofory, které reagují na vazbu proteinu změnou fluorescence, případně DNA modifikovanou reaktivními skupinami typu aromatických azidů nebo Michaelových akceptorů. Bude zkoumán především vliv těchto skupin na přesnost rozpoznání modifikovaných cílových míst v DNA zmíněnými proteiny.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
23. 5. 2016 05:47, doc. RNDr. Miroslav Fojta, CSc., učo 31900
Plný text práce
2,4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
9. 6. 2016
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Miroslav Fojta, CSc., učo 31900
SIBP CSB CEITEC MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Konzultanti

Ing. Zuzana Ferenčíková, Ph.D.
Mgr. Petr Orság, Ph.D., učo 21288
SIBP CSB CEITEC MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.