Master's thesis

Information system for the administration of biological samples

Informační systém pro administraci biologických vzorků

Bc. David Vávra
Abstract

Cílem této práce bylo představení oblasti "Biobanking" a nalezení vhodného softwarového řešení pro administraci biologických vzorků. Součástí tohoto cíle bylo analyzovat, lokalizovat a modifikovat webový informační systém caTissue Plus tak, aby byl použitelný v českém prostředí.

Abstract

The goal of this thesis is to introduce Biobanking and to find suitable software solution for administration of biological samples. Part of this goal is to analyze, localize and modify web-based IS called caTissuePlus to be usable in czech environment also.

Keywords
Biobanking Informační systém Biologické vzorky Lokalizace caTissue Java MVC MySQL JBoss Adobe Flex Data management
Thesis description
Biobanky jsou dobře organizované zdroje shromažďující biologické vzorky a související informace, které následně slouží pro vědecký výzkum. S rostoucím množstvím archivovaných vzorků roste potřeba katalogizace a sdílení informací o uložených vzorcích ve vhodném informačním systému. Pro tuto oblast existuje kromě komerčních softwarových produktů i open source aplikační software caTissue Suite (webová aplikace v JAVA prostředí), který je součástí projektu cancer Biomedical Informatics Grid organizace National Cancer Institute (NCI). Je dále rozvíjen speciálně pro potřeby administrace biologických vzorků ve světě. Nebyl však dosud lokalizován v českém prostředí. Cílem diplomové práce je provést analýzu caTissue Suite a navrhnout a vytvořit informační systém pro administraci biologických vzorků s využitím lokalizace a modifikace caTissue Suite pro české prostředí. Lokalizací je míněna podpora české diakritiky, českého formátu datumu a české uživatelské prostředí. Vývoj nového informační systému vycházejícího z caTissue Suite bude probíhat dle požadavků spolupracující biobanky na pracovišti v Brně a bude se týkat jak úpravy uživatelského prostředí , tak i funkce importu stávajících dat.
Administrative information
The thesis has been checked:
31/5/2014 12:23, prof. RNDr. Jiří Hřebíček, CSc.
Full text of thesis
1,1 MB / file PDF
Language used
Czech Czech
Defence date
26/6/2014
The thesis was defended successfully

Supervisor

prof. RNDr. Jiří Hřebíček, CSc.
RECETOX PřF MU

Reader

RNDr. Roman Šmíd, Ph.D., UČO 3993
IBA SpolP LF MU

Consultant

RNDr. Daniel Klimeš, Ph.D., UČO 11180
IBA SpolP LF MU

Literature

  • PECINOVSKÝ, Rudolf. Návrhové vzory : [33 vzorových postupů pro objektové programování]. Vyd. 1. Brno: Computer Press, 2007, 527 s. ISBN 9788025115824.
  • MARRS, Tom and Scott DAVIS. JBoss at work : a practical guide. 1st ed. Sebastopol, CA: O'Reilly, 2006, xvi, 287. ISBN 0596007345.
Cite this text
Masaryk University Faculty of Informatics
Programme
Applied Informatics
Field of Study

Theses on a related topic

List of theses with an identical keyword.

Similar documents

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.