Diplomová práce

Evoluční historie druhového komplexu Praomys jacksoni (Rodentia: Murinae)

Evolutionary history of the Praomys jacksoni species complex (Rodentia: Murinae)

Bc. Daniela Mizerovská
Anotace

Myšovití hlodavci jsou v Africe (a nejen tam) pro člověka důležitou skupinou živočichů, a to především jako přenašeči nemocí (např. Lassa virus) nebo jako škůdci plodin. Zároveň však mohou sloužit jako výborný evoluční model pro popis procesů vzniku současné biologické rozmanitosti. Hlodavci mají vysokou mutační rychlost mitochondriální DNA, jsou vázání na specifický typ habitatu a zároveň nejsou schopni …více

Abstract

Murid rodents are really important group of animals in Africa (and not just there), being detrimental to humans as disease carriers (e.g. Lassa virus) or as crop pests. At the same time, rodents can be used as a perfect evolutionary model for analyzing the processes forming contemporary biodiversity. Rodents have high mtDNA substitution rate and low dispersal ability, they are linked to specific habitats …více

Zadání práce
Navzdory ekonomické, medicínské a ekologické významnosti hlodavců je jejich evoluční historie dosud nedostatečně prozkoumána. Nejméně znalostí je pak o hlodavcích z méně prozkoumaných oblastí, např. z tropické Afriky, a to i přes výraznější negativní důsledky hlodavců na zemědělství a lidské zdraví v těchto rozvojových oblastech. Jedním z nejrozmanitějších a nejpočetnějších hlodavců subsaharské Afriky jsou pravé myši rodu Praomys. Tento rod o 17-20 druzích však dle více studií s posledních let není monofyletický, neboť zahrnuje několik linií, které nejsou blízce příbuzné. Jednou z pěti linií rodu „Praomys“ je komplex druhů P. jacksoni obsahující pět druhů: P. jacksoni, P. minor, P. mutoni, P. degraaffi a dosud nepopsaný P. sp. B. Tato bezpochyby monofyletická evoluční linie je tou poslední, které chybí molekulárně fylogenetická revize, delimitace druhů a sumarizace jejich geografické distribuce. Cílem diplomové práce bude souhrn publikovaných znalostí o taxonomii, evoluční historii a rozšíření druhů komplexu P. jacksoni, komplexní fylogenetická analýza založená na kombinaci mitochondriálních a jaderných znaků, tj. všechny sekvence dostupné z veřejných zdrojů (databáze GenBank), od spolupracovníků i vlastních odchytů týmu vedoucího a konzultanta. Student bude generovat sekvenační data v molekulárně genetické laboratoři a samostatně vyhodnotí získaná data za využití aktuálních fylogenetických a fylogeografických přístupů včetně analýz delimitace druhů a molekulárního datování. Součástí bude i stáž v Musée National d Histoire Naturelle v Paříži u Dr. Violaine Nicolas, přední odbornice na drobné zemní savce Afriky. Výsledná diplomová práce poskytne základ pro odbornou publikaci rekonstruující evoluční historii a současnou distribuci myší komplexu P. jacksoni.
Práce zkontrolována:
3. 5. 2018 07:50, prof. Mgr. et Mgr. Josef Bryja, Ph.D., učo 7775
Plný text práce
3,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
11. 6. 2018
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. Mgr. et Mgr. Josef Bryja, Ph.D., učo 7775
ÚBZ Biol PřF MU

Oponent

prof. RNDr. Miloš Macholán, CSc., učo 31702
ÚBZ Biol PřF MU

Konzultant

Mgr. Adam Konečný, Ph.D., učo 52434
ÚBZ Biol PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.