Bakalářská práce

Genetická predispozice ke klíšťové encefalitidě: analýza polymorfismů v genu ABCG1

Genetic Susceptibility to Tick-Borne Encephalitis: Analysis of ABCG1 Gene Polymorphisms

Valentina Bernátová
Anotace

Klíšťová encefalitida (KE) představuje závažné neuroinfekční onemocnění s výraznou interindividuální variabilitou v klinickém průběhu. Vedle vlastností viru se na vnímavosti k infekci a závažnosti onemocnění mohou podílet také genetické faktory hostitele. Tato bakalářská práce byla zaměřena na analýzu jednonukleotidových polymorfismů (SNP) v genu ABCG1 (rs35873421, rs3787986) a v blízkosti genu FTO …více

Abstract

Tick-borne encephalitis (TBE) is a serious neuroinfectious disease characterized by significant interindividual variability in its clinical course. Besides viral properties, host genetic factors may play a role in infection susceptibility and disease severity. This bachelor’s thesis focuses on the analysis of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the ABCG1 gene (rs35873421, rs3787986) and near …více

Klíčová slova
ABCG1 FTO genetická predispozice jednonukleotidový polymorfismus (SNP) klíšťová encefalitida (KE) TaqMan genotypizace genetic predisposition single nucleotide polymorphism (SNP) tick-borne encephalitis (TBE) TaqMan genotyping
Zadání práce

Anotace:
Klíšťová encefalitida (KE) představuje závažné virové onemocnění centrálního nervového systému, které se vyskytuje především v endemických oblastech Evropy a Asie. Na základě nedávné genomové studie byla identifikována možná souvislost mezi genetickou predispozicí k infekci virem KE a polymorfismy v genu ABCG1. Tato bakalářská práce se zaměřuje na analýzu dvou vybraných jednonukleotidových polymorfismů (rs35873421 a rs3787986) a jejich frekvence u pacientů s KE ve srovnání se zdravou populací.

Cílem experimentální práce je přispět k objasnění genetických faktorů, které mohou ovlivňovat náchylnost k infekci a závažnost průběhu onemocnění.

Metodologie:
Z genomové DNA izolované z plné krve pomocí kitu QIAamp DNA Blood Mini Kit (Qiagen, Hilden, Německo) bude provedena genotypizace pomocí TaqMan SNP Genotyping Assay (ThermoFisher Scientific, Waltham, MA, USA). Polymerázová řetězová reakce (PCR) bude realizována na systému LightCycler 480 (Roche, Indianapolis, USA) ve 96-jamkových destičkách. Genotypové a alelové frekvence SNP budou porovnány mezi skupinami pacientů a kontrol pomocí x2 testu v programu GraphPad Prism 9 verze 9.3.0 (GraphPad Software, La Jolla, CA, USA).

Literatura k dispozici u školitele.

Administrativní informace
Práce zkontrolována:
18. 5. 2026 10:18, prof. RNDr. Daniel Růžek, Ph.D., učo 100599
Plný text práce
982,2 KB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
19. 6. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Daniel Růžek, Ph.D., učo 100599
Mikrob ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Mgr. Martina Grochová
Státní ústav jaderné, chemické a biologické ochrany, v.v.i., Laboratoř biologického monitorování a ochrany, Kamenná 71, 262 31 Milín

Konzultant

Mgr. Andrea Fořtová, Ph.D., učo 8118
Mikrob ÚEB Biol PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Mikrobiologie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.