Alternativa bakalářské práce: Sarah Ondrejčáková: Vazebné peptidy jako nový přístup k inhibici exonukleázy 1
Alternativa bakalářské práce
Vazebné peptidy jako nový přístup k inhibici exonukleázy 1
Peptide binders as a new approach to inhibit exonuclease 1
Anotace
Exonukleáza 1 (EXO1) je štruktúrne špecifická nukleáza s kľúčovou úlohou v procesoch opravy DNA, vrátane homologickej rekombinácie a opravy nesprávne párovaných báz. Jej nadmerná expresia je asociovaná s progresiou viacerých typov nádorových ochorení. Inhibícia EXO1 preto predstavuje sľubný terapeutický prístup, najmä v kontexte synteticky letálnych interakcií identifikovaných v BRCA1-deficientných …více
Abstract
Exonuclease 1 (EXO1) is a structure-specific nuclease with a key role in DNA repair processes, including homologous recombination and mismatch repair. Its overexpression is associated with the progression of several types of cancer. Inhibition of EXO1 therefore represents a promising therapeutic approach, particularly in the context of synthetic lethal interactions identified in BRCA1-deficient cancer …více
Zadání alternativy bakalářské práce
Dvouřetězcové zlomy představují jeden z nejtoxičtějších druhů poškození DNA a vedou k nestabilitě genomu. Homologní rekombinace je mechanismus zodpovědný za jejich přesnou opravu. Mutace klíčových proteinů, které se na opravě podílejí, vedou k predispozici k rakovině prsu, vaječníků, pankreatu a prostaty, a byly rovněž asociovány s Fanconiho anemií. Detailní pochopení interakce a regulace aktivit těchto proteinů představuje jeden ze základních principů, které mohou vést nejen k objasnění molekulárního mechanismu homologní rekombinace, ale i k terapeutickému využití. Projekt tedy bude zaměřen na studium jevů probíhajících během opravy DNA za využití biochemických, molekulárně biologických a biofyzikálních metod.
Cílem práce bude formulovat vědeckou hypotézu a stanovit konkrétní cíl samostatného vědeckého projektu zaměřeného na mechanizmy opravy dvouřetězcových zlomů DNA prostřednictvím homologní rekombinace. V rámci projektu bude detailně analyzována interakce a regulace klíčových proteinů podílejících se na tomto procesu, se zaměřením na jejich funkční roli v kontextu genomové stability a predispozice k onemocněním spojeným s defekty v homologní rekombinaci.
Součástí práce bude návrh metodického přístupu zahrnujícího biochemické, biofyzikální a strukturální techniky pro charakterizaci vybraných proteinů a jejich komplexů. Důraz bude kladen na optimalizaci experimentálních podmínek, získání kvantitativních i kvalitativních dat a jejich interpretaci ve vztahu k molekulárním mechanismům opravy DNA.
3. 6. 2026 11:03, doc. Mgr. Lumír Krejčí, Ph.D., učo 18098
Upozornění:
Závěrečná práce byla v souladu s § 47b zákona o vysokých školách skryta z důvodu překážky pro její zveřejnění do 31. 12. 2029.
Odůvodnění: Zveřejnění Závěrečného projektu je odloženo do 31.12.2029.
Vedoucí
Konzultant
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
Pokroky v léčbě vysoce rizikových leukemií a lymfomů
Bc. Ema Joudalová -
Syntéza nových substituovaných aminothiazolů
Bc. Marco Vitek -
Potenciál inhibice proteinu Checkpoint kinase 1 u B-buněčných malignit
Mgr. Miroslav Boudný, Ph.D., učo 393305 -
Nukleázy účastnící se opravy DNA jako cíl syntetické letality
Mgr. Magdaléna Kalovská -
Mechanizmy rezistence nádorových buněk vůči chemoterapii
Mgr. Zuzana Šrámková, Ph.D. -
Kontrolní body buněčného cyklu a oprava DNA ve vztahu k protinádorové terapii
Mgr. Jana Figulová -
Validace synteticky letálních partnerů endonukleázy MUS81
Mgr. Magdaléna Kalovská -
Role transkripčních faktorů STAT v interakcích mikroprostředí buněk chronické lymfocytární leukémie
Mgr. Bc. Erika Bajusová




