Bakalářská práce

Screening CRISPR/Cas9-indukovaných pericentrických inverzí u druhu Thlaspi arvense

Screening of CRISPR/Cas9-Induced pericentric inversions in Thlaspi arvense

Johana Šašková
Anotace

Inverze představují významné chromozomové přestavby, které přispívají k evoluci genomu, potlačení rekombinace a speciaci rostlin. Současný pokrok v editaci genomu pomocí systému CRISPR/Cas umožnil cílenou indukci těchto přestaveb. Tato bakalářská práce se zabývá detekcí 54 Mb, CRISPR/Cas9-indukované, inverze na chromozomu 1 u dvou generací druhu Thlaspi arvense. Rostliny generací T1 a T2 byly analyzovány …více

Abstract

Inversions are significant chromosomal rearrangements that contribute to genome evolution, recombination suppression, and plant speciation. Recent advances in CRISPR/Cas-mediated genome editing have enabled the targeted induction of these rearrangements. This bachelor’s thesis focused on the screening of two generations of Thlaspi arvense for a 54 Mb inversion on chromosome 1 induced by CRISPR/Cas9 …více

Klíčová slova
chromozomové přestavby CRISPR/Cas Editace genomu Inverze Thlaspi arvense chromosomal rearrangements Genome editing Inversion
Zadání práce
Technologie CRISPR/Cas9 představuje účinný nástroj pro cílené modifikace rostlinného genomu a umožňuje studium komplexních chromozomových přestaveb, jako jsou inverze. Tato bakalářská práce se zaměřuje na detekci pericentrických inverzí na chromozomu 1 u rostlinného druhu penízek rolní (Thlaspi arvense), které byly indukovány pomocí CRISPR/Cas9 s cílem obnovit strukturu odpovídající předpokládanému karyotypu předka. Práce zahrnuje selekci transformovaných rostlin, izolaci genomové DNA, optimalizaci PCR screeningu a analýzu T1 generace, případně i T2 generace u pozitivních jedinců. Výstupem bude identifikace rostlin s potvrzenou inverzí, ideálně v homozygotním stavu, a statistické vyhodnocení efektivity transformace a frekvence indukovaných přestaveb. Výsledky přispějí k hlubšímu porozumění evolučním procesům formování rostlinných karyotypů a ukážou potenciál cílené genomové editace pro studium chromozomové evoluce. Bakalářská práce bude experimentální.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
16. 5. 2026 09:01, Mgr. Petr Janás, učo 451496
Plný text práce
1,7 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
11. 6. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Petr Janás, učo 451496
CGR MCGPR CEITEC MU

Oponent

Ing. Pavla Novotná
stud PřF MU

Konzultant

RNDr. Terezie Malík Mandáková, Ph.D., učo 64119
Genet ÚEB Biol PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Molekulární biologie a genetika

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.