B5000 Aplikace PC v molekulární biologii a genetice

Přírodovědecká fakulta
podzim 2000
Rozsah
0/3/0. 4 kr. Ukončení: kz.
Vyučující
RNDr. Ing. Karel Chroust, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Popis osobního počítače - hardware, obsluha. Operační systémy. Popis příkazů MS-DOS 6.2, pomocné programy - Norton Commander. Práce v prostředí MS Windows98. Textové editory - MS Word 97. Tabulkové procesory - MS Excel 97. Vytváření grafů, výpočty, statistické funkce, databázové funkce, makra. Statistické programy - výpočty příkladů z obecné genetiky a genetiky kvantitativních znaků. Internet - Telnet (základní příkazy v Unixu), World-Wide-Web, získávání souborů (FTP), zájmové konference v síti. Informační služby v počítačových sítích - využití v molekulární biologii a genetice. Prohledávání citačních databází (Current Contents, Medline). Vyhledávání sekvencí nukleových kyselin a proteinů v databázích (BLAST, Fasta). Porovnávání sekvencí. Hledání genů a funkčních oblastí. Funkční genomika. Výzkum genomu (lidský genom, myší genom, Saccharomyces, Drosophila, Arabidopsis). Specializované programy pro molekulární biologii. Analýza sekvencí (DNASIS). Analýza elektroforetických gelů (GelCompar).
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 1999, podzim 2001.