Závěrečná práce: Zdeněk Hruška: Registrace obrazů řezů histologických preparátů
Bakalářská práce
Registrace obrazů řezů histologických preparátů
Image Registration of Slices of Histological Specimen
Anotace
Tato práce se zabývá registracemi obrazu, konkrétně registrací obrazů řezů histolo-gických preparátů. Jedná se o různé fyzické řezy tkáně, které mají mírně rozdílné tvary a parametry. Stěžejním bodem práce bylo vytvořit aplikaci v jazyce C++ za pomocí knihovny i3d. Popisem aplikace se práce převážně zabývá. Aplikace funguje v zásadě tak, že vstupní obrazy nejdříve odprahuje a následně z nich odhadne…více
Abstract
This bachelor thesis deals with image registration, namely registration of histological sections. There are different physical tissue sections, which have slightly different shapes and parameters. The main point of this thesis was to program an application in C++ using library i3d. The description of the application is the main topic of this thesis. The application works on the principle that it first…více
Zadání práce
Cílem práce je vytvořit program, který dle potřeby posune, otočí a překlopí obrázky ze zadané série 2D obrázků tak, aby všechny obrázky v sérii byly slícovány (zregistrovány), tzn. aby se takříkajíc překrývaly pokud bychom si je zobrazily přes sebe. Každá obrazová série představuje řez tkáně, která byla patologem fyzicky rozřezána, obarvena a nasnímána. Jednotlivé řezy jsou proto zobrazeny v různých polohách. A protože se jedná o tkáň, nejdou často na sebe dokonale napasovat.
V teoretické části práce student stručně popíše princip standardních registračních metod, zhodnotí jejich vhodnost pro tento problém a popíše postup, který nakonec implementoval. V praktické části práce provede případovou studii, případně ukáže výsledky testů programu.
Naprogramovaný kód bude pod licencí GNU GPL a bude dobře zdokumentovaný. Předpokladem zápisu je znalost programování v C/C++. Kurz PV131 výhodou.
23. 5. 2012 12:34, RNDr. Vladimír Ulman, Ph.D., učo 4203
Vedoucí
Práce na příbuzné téma
Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.
-
GPU Acceleration of Image Processing Algorithms
RNDr. Pavel Karas, Ph.D., učo 106808 -
Nástroje GIS pro účely zpracování digitálních fotografií.
Mgr. Eliška Trnková -
Skládaná digitální makrofotografie pomocí řady zaostřených fotografií
Bc. Jan Kaderka -
Využití HDR pro efektivní rekonstrukci 3D objektů
Bc. Petra Tomanová -
Využití obrazové analýzy k určování pH neznámých chemických sloučenin
Mgr. Martin Kuriplach -
Semi-automatic tools for image segmentation
Mgr. Martin Moučka -
Automatická detekce mikroplastů v mikroskopických snímcích půdy
Mgr. David Pavlík -
Segmentace a popis obrazů členovců
Mgr. Martin Mejzlík