Rychlý přehled:

• jak zajistit udržitelnost a replikovatelnost výzkumu, kniha kap. 16
• tvorba dokumentů a prezentací v R v systému quarto, kniha kap. 17
• slides s nejnutnějšími základy pro obě témata

Témata: 

• co je reproducible research, organizace práce, správa verzí, budoucí funkčnost kódu, kniha kap. 16
• quarto (co to je a k čemu to je, jak se to udělá, hlavní značky, hlavní parametry), kniha kap. 17

• není

• zadání 
• data
• řešení: report v HTML, report v PDF a plné řešení

Ukázky:

• velká interaktivní aplikace v R/shiny, která vizualizuje dopravní nehody (veřejná=ořezaná verze)

• reproducible research:
  • Hennigsen's Guidelines
  • Ten Simple Rules
• Quarto a spol.:
  • Quarto
  • Pandoc (detailní popis klonu markdownu, nad kterým stojí R Markdown i Quarto, plus konvertoru do mnoha různých formátů)
  • R Markdown:
    • cheatsheets: ​základní a reference guide
    • RStudio: R Markdown (základy a ukázky)
    • Yihui Xie, J. J. Allaire, Garrett Grolemund: R Markdown: The Definitive Guide (ultimátní zdroj)
    • Yihui Xie​: knitr (detailní popis konvertoru z R do Pandoc Markdownu, zejména všech chunk a global options)
      
• LaTeX (stačí matematika):
• LaTeX/Mathematics on Wikibooks
• git:
  • https://www.atlassian.com/git
    

• není

-

LaTeX/Mathematics