Domácí cvičení 5 [max. 4 body; odevzdat do 25.4. 13:00]

Z portálu e-cyanobacterium.org stáhněte model Myioshi et al. 2007 ve formátu SBML. Prohlédněte strukturu staženého SBML souboru. Nainstalujte nástroj CellDesigner (celldesigner.org) a otevřete v něm stažený SBML model (warning související s kvantitativním nastavením některých parametrů ignorujte). Aplikujte vhodný layout na automaticky vytvořený SBGN PD (např. hierarchický nebo ortogonální layout). V textovém souboru popište alespoň 3 aspekty, v nichž by bylo možné SBGN diagram zlepšit tak, aby lépe využíval možností SBGN notace.

Výstup: ZIP archív obsahující obrázek "zlayoutovaného" SBGN diagramu (PDF) a textový soubor s popisem výše zmíněných aspektů. Vložte do odevzdávárny.