Seminář z bioinformatiky
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Seminář z bioinformatiky
Info
Období
podzim 2011
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 10. 10. 2011 do 16. 10. 2011.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
Učitel doporučuje studovat od 17. 10. 2011 do 23. 10. 2011.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
Učitel doporučuje studovat od 24. 10. 2011 do 30. 10. 2011.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
Učitel doporučuje studovat od 31. 10. 2011 do 6. 11. 2011.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
Učitel doporučuje studovat od 7. 11. 2011 do 13. 11. 2011.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
Učitel doporučuje studovat od 14. 11. 2011 do 20. 11. 2011.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
Učitel doporučuje studovat od 21. 11. 2011 do 27. 11. 2011.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
Učitel doporučuje studovat od 28. 11. 2011 do 4. 12. 2011.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
Učitel doporučuje studovat od 5. 12. 2011 do 11. 12. 2011.

Týden 1 - Organizace semináře

Harmonogram semináře je už promítnut do osnov, do 4.10 si studenti vyberou tému ke studiu a prezentaci. Může se jednat o jeden z článků  v studijních materiálech, nebo zaměřením podobný článek z jiné dostupné literatury. Náplní semináře je bioinformatika proteinů. Před výběrem článku k prezentaci se přesvědčte, zda nebyl už použit Vašimi kolegy.

Týden 1 - Lukáš Pravda (10.10.2011)

Orosz_et_al_2011
Proteins without 3D structure: definition, detection and beyond

Týden 2 - Jana Zuczková (17.10.2011)

Liu_et_al_2011
Structural analysis of the hot spots in the binding between H1N1 HA and the 2D1 antibody: do mutations of H1N1 from 1918 to 2009 affect much on this binding?

Týden 3 - Jan Jílek (24.10.2011)

Kota_et_al_2011
Gaia: automated quality assessment of protein structure models

Týden 4 - Andras Marczell (31.10.2011)

Sahota_and_Stormo_2010
Novel sequence-based method for identifying transcription factor binding sites in prokaryotic genomes

Týden 5 - Ivan Vogel (7.11.2011)

Ta_et_al_2010
A Novel Method for Assigning Functional Linkages to Proteins Using Enhanced Phylogenetic Trees

Týden 6 - Juraj Nižnan (14.11.2011)

Fox_et_al_2011
Connectedness of PPI network neighborhoods identifies regulatory hub proteins

Týden 7 - Tomáš Benčok (21.11.2011)

Savojardo_et_al_2011
Improving the prediction of disulfide bonds in Eukaryotes with machine learning methods and protein subcellular localization

Týden 8 - Dušan Kladivík (28.11.2011)

Goncearenco_et_al_2011
Computational reconstruction of primordial prototypes of elementary functional loops in modern proteins

Týden 9 - Matej Hajnal (5.12.2011)

Bauer_et_al_2011
Sorting the nuclear proteome