Vizualizace komplexních dat
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Vizualizace komplexních dat
Info
Období
podzim 2015
Kapitola obsahuje:
4
PDF
9
Web
Učitel doporučuje studovat od 23. 9. 2015 do 30. 9. 2015.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní materiály
10
Web
Učitel doporučuje studovat od 30. 9. 2015 do 7. 10. 2015.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
1
Studijní materiály
1
Studijní text
2
Web
Učitel doporučuje studovat od 7. 10. 2015 do 14. 10. 2015.
Kapitola obsahuje:
1
PDF
2
Studijní materiály
1
Studijní text
2
Web
Učitel doporučuje studovat od 14. 10. 2015 do 21. 10. 2015.
Kapitola obsahuje:
1
Studijní materiály
1
Studijní text
3
Web
Učitel doporučuje studovat od 21. 10. 2015 do 28. 10. 2015.
Kapitola obsahuje:
1
Studijní materiály
1
Studijní text
4
Web
Učitel doporučuje studovat od 28. 10. 2015 do 4. 11. 2015.
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
3
Web
Učitel doporučuje studovat od 4. 11. 2015 do 11. 11. 2015.
Týden 8 - 10.11.2015
Učitel doporučuje studovat od 11. 11. 2015 do 18. 11. 2015.
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
2
Web
Učitel doporučuje studovat od 18. 11. 2015 do 25. 11. 2015.
Kapitola obsahuje:
1
Studijní materiály
Učitel doporučuje studovat od 2. 12. 2015 do 9. 12. 2015.
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
1
Web
Učitel doporučuje studovat od 9. 12. 2015 do 16. 12. 2015.

Týden 1 - 22.9.2015

Týden 2 - 29.9.2015

Týden 3 - 6.10.2015

TYPY KOMPLEXNICH DAT

1. velke mnozstvi dat

2. mnohorozmernost

3. sitovy charakter

4. heterogenni data

TECHNIKY PRACE S KOMPLEXNIMI DATY

1. Redukce dimenzi, shlukovani

2. Konverze, filtrace, hledani asociaci, dolovani znalosti

TECHNIKY VIZUALIZACE

1. Trellis plot

2. Mosaic plot

3. Paralelni osy

4. Kombinace vice typu vizualizaci

5. Interaktivita/Grand Tour

PREZENTACE

Adam Mertel: D3 kniznica http://d3js.org

Peter Ondrejka: Leaflet https://rstudio.github.io/leaflet/

Týden 4 - 13.10.2015

Úkol 2 (5bodu): Pomoci vhodných funkcí a balíků v R proveďte LDA analýzu dat "cars" tak, aby jste nalezli lineární kombinaci objemu motoru, rychlosti, hmotnosti a roku výroby, která nejlépe separuje veličinu "pocet valců" do kategorií <5, 5-6 a >6

 

Výsledky práce doručte, prosím, e-mailem na lexa@fi.muni.cz s obrázkem výsledku LDA a R kódem. Názevať obsahuje slova "PA055 úkol 2". Termín: 20.10.2015 10:00

PREZENTACE

Jan Šťastný: "Vizualizace volumetrických dat"

 

Petr Štěpánek: "Problémy vizualizace a interpretace dat"

Týden 5 - 20.10.2015

PREZENTACE:

Josef Daňa: "Vizualizace komplexních sítí"

Ukol z cviceni - pohyblive a regaujici vrcholy grafu - 2 body.

Týden 6 - 27.10.2015

Úkol 4 (4 body)

Implementujte v Processingu systém pro interaktivní zobrazování velkých grafů se zvětšeným náhledem na okolí uzlů v okolí středu obrazovky.

Požadavky:

1) Po spuštění programu se vygenuruje náhodný obecný graf s náhodným rozmístěním uzlů

1) Uzly lze přemísťovat myší

2) Po kliknutí na uzel se zobrazí (dočasně nebo do dalšího kliknutí) jeho identifikace

3) Uzly trvale optimalizují svoji polohu na základě Vámi zvoleného algoritmu

4) Uzly mají náhodně přidělené váhy, které ovlivňují jejich vzhled a vliv na okolité uzly

5) Zobrazení zahušťuje a zmenšuje uzly daleko od středu obrazovky (např. transformací r = R - k/(sqrt(x^2+y^2) + 1; alfa = arcsin(x/r)), kde x a y jsou karteziánské souřadnice, r a alfa jsou polární souřadnice po transformaci, které je nutné převést na transformované karteziánské xnew = sin(alfa)*r; ynew = cos(alfa)*r)

BONUS: 1 bod za implementaci načítání dat ze souboru

 

Týden 7 - 3.11. 2015

PREZENTACE

Matej Trojak: Fluorescenčná mikroskopia

Jakub Salagovic: "Nesprávne vizualizácie a pravidlá, ktoré porušujú"

Prezentace zameru projektu (2 body pr kazdeho v uspesne prezentujicim tymu).

Pripravte si nekolik obrazku pro projektor, na kterych nas seznamite se svym zamerem na projekt, zdrojem dat, ocekavanou podobou finalni vizualizce.

Týden 8 - 10.11.2015

Týden 8 - 10.11.2015

Obsah není zveřejněný.

Týden 9 - 24.11.2015

PREZENTACE

Vojta David: ?

Jaroslav Bayer: ?

Jan Šťourač: Mnoho tváří biomolekul

Pavla Suchánková: ?

Týden 10 - 1.12.2015 - volno

Týden 13 - 8.12.2015

Minikonference semestrálních projektů (připravte 10-min prezentaci)

 

Semestrální projekty:

1) Jan Štourač, Pavla Suchánková - Vizualizace informaci o miRNA v kontextu bunky

2) Jakub Šalagovič, Matej Troják - Vizualizacia biochemickeho stavoveho priestoru

3) Petr Štěpánek, Josef Daňa - Vizualizace sítě spoluautorství 

4) Adam Mertel, Peter Ondrejka - Vizualizace archeologickych dat Vysociny

5) Jakub Valtar = Vizualizace dat MSMT o studiu na VS v CR

6) Jaroslav Bayer, Vojta David - Zapisy predmetu na FI

7) Jan Šťastný - Vizualice dynamiky prostoru v objemovych datech: aplikace na tunely v proteinech

Hodnoceni (30b): vcasne vypracovani a prezentace na zaver semestru (5b), naplneni schvaleneho zadani (5b), dokumentace nebo/a zdrojovy kod (5b), celkovy dojem a kvalita zpracovani (10b), narocnost a dalsi technicke stranky zpracovani(5b)