IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2024
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučováno kontaktně - Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- St 18. 9. až St 11. 12. St 16:00–16:50 A319
- Předpoklady
- Od zájemců se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, případně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice (hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak). U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 36 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti bioinformatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou účasti na přednáškách externých hostů a studia vhodných vědeckých článků samotnými studenty.
- Výstupy z učení
- Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze.
- Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní studii (z navržených článků nebo po konzultaci) z oblasti
- Metody sekvenace DNA nanoporovým sekvenováním
- Nástroje a algoritmy pro zpracování dlouhých sekvencí a sekvencí z nanopórového sekvenování
- Genomické a biologické studie postaveny na sekvenování nanopórem
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze; přednášky zvaných odborníků
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu; písemný souhrn obsahu přednášky
- Navazující předměty
- Informace učitele
- Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals covering bioinformatics (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2023
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- St 16:00–16:50 A319
- Předpoklady
- Od zájemců se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, případně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice (hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak). U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 85 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti bioinformatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou účasti na přednáškách externých hostů a studia vhodných vědeckých článků samotnými studenty.
- Výstupy z učení
- Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze.
- Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní studii (z navržených článků nebo po konzultaci) z oblasti
- Metody sekvenace DNA nanoporovým sekvenováním
- Nástroje a algoritmy pro zpracování dlouhých sekvencí a sekvencí z nanopórového sekvenování
- Genomické a biologické studie postaveny na sekvenování nanopórem
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze; přednášky zvaných odborníků
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu; písemný souhrn obsahu přednášky
- Navazující předměty
- Informace učitele
- Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals covering bioinformatics (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2022
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Monika Čechová, Ph.D. (přednášející) - Garance
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- St 16:00–16:50 A319
- Předpoklady
- Od zájemců se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, případně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice (hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak). U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 85 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti bioinformatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou účasti na přednáškách externých hostů a studia vhodných vědeckých článků samotnými studenty.
- Výstupy z učení
- Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze.
- Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní studii (z navržených článků nebo po konzultaci) z oblasti
- Metody sekvenace DNA nanoporovým sekvenováním
- Nástroje a algoritmy pro zpracování dlouhých sekvencí a sekvencí z nanopórového sekvenování
- Genomické a biologické studie postaveny na sekvenování nanopórem
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze; přednášky zvaných odborníků
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu; písemný souhrn obsahu přednášky
- Navazující předměty
- Informace učitele
- Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals covering bioinformatics (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2021
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- Mgr. Monika Čechová, Ph.D. (přednášející)
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející) - Garance
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- St 15. 9. až St 8. 12. St 16:00–16:50 A319
- Předpoklady
- Od zájemců se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, případně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice (hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak). U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 85 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti bioinformatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou účasti na přednáškách externých hostů a studia vhodných vědeckých článků samotnými studenty.
- Výstupy z učení
- Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze.
- Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní studii (z navržených článků nebo po konzultaci) z oblasti
- Metody sekvenace DNA nanoporovým sekvenováním
- Nástroje a algoritmy pro zpracování dlouhých sekvencí a sekvencí z nanopórového sekvenování
- Genomické a biologické studie postaveny na sekvenování nanopórem
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze; přednášky zvaných odborníků
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu; písemný souhrn obsahu přednášky
- Navazující předměty
- Informace učitele
- Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals covering bioinformatics (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).
- Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2020
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Čt 11:00–11:50 C416
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, přpadně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 85 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
- Výstupy z učení
- Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze.
- Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2019
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Út 9:00–9:50 B411
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, přpadně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 85 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
- Výstupy z učení
- Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze.
- Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2018
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Po 17. 9. až Po 10. 12. Po 15:00–15:50 B411
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, přpadně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 48 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze. - Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2017
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Po 8:00–9:50 C416
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, přpadně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 48 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze. - Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2016
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Po 12:00–13:50 C525
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, přpadně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 48 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze. - Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2015
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Čt 18:00–19:50 B411
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, přpadně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 48 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze. - Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2014
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Pá 12:00–13:50 C511
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, přpadně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 47 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze. - Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2013
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh seminárních/paralelních skupin
- IV105/01: Po 14:00–14:50 B411, M. Lexa
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, přpadně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 47 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze. - Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2012
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Út 8:00–8:50 B411
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce, přpadně nastudovat použití specializovaných programů a výpočetních nástrojů v bioinformatice. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 47 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze. - Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2011
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Po 9:00–9:50 B411
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 47 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze. - Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2010
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Út 17:00–17:50 B411
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 45 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze. - Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2009
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Út 17:00–17:50 B410
- Předpoklady
- Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 45 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence".
Studenti získají přehled o vědeckých problémech v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se ve vystupování před publikem a vedení diskuze. - Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Předpovídání struktury a funkce proteinů ze sekvence
- Hodnocení podobnosti molekul
- Analýza a vizualizace signálních a metabolických sítí
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Výukové metody
- studentské prezentace a diskuze
- Metody hodnocení
- Studentská prezentace nastudovaného materiálu
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Nucleic Acids Research) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB). - Další komentáře
- Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2008
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Út 16:00–16:50 B204
- Předpoklady
- Od zájemců o tento silně mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 38 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů formou studia vhodných vědeckých článků s novými metodami a interpretacemi. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence". Kurz se bude konat jednou týdně po 1 hodině, kolokvium získá každý student, který úspěšně odprezentuje nastudovanou metodu.
- Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Literatura
- ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info
- Metody hodnocení
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů. Kolokvium absolvuje každý student, který úspěšně odprezentuje nastudovanou metodu.
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2007
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Út 17:00–17:50 B411
- Předpoklady
- Od zájemců o tento silně mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 38 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence". Kurz se bude konat jednou týdně po 1 hodině, kolokvium získá každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.
- Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Metody hodnocení
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů. Na konci kurzu absolvují studenti krátký kontrolní test. Kolokvium absolvuje každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2006
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Út 9:00–9:50 B411
- Předpoklady
- Od zájemců o tento silně mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 18 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence". Kurz se bude konat jednou týdně po 1 hodině, kolokvium získá každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.
- Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Metody hodnocení
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů. Na konci kurzu absolvují studenti krátký kontrolní test. Kolokvium absolvuje každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2005
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Út 11:00–11:50 B411
- Předpoklady
- Od zájemců o tento silně mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 18 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence". Kurz se bude konat jednou týdně po 1 hodině, kolokvium získá každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.
- Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Metody hodnocení
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů. Na konci kurzu absolvují studenti krátký kontrolní test. Kolokvium absolvuje každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/teaching.html
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikypodzim 2004
- Rozsah
- 1/0/1. 2 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: k. Jiná možná ukončení: z.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. PhDr. Karel Pala, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Rozvrh
- Út 11:00–12:50 B411
- Předpoklady
- Od zájemců o tento silně mezioborový kurz se očekávají alespoň základní znalosti programování, popřípadě schopnost se je v průběhu semestru naučit (není náplní předmětu). Schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce je výhodou. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky. K programování a řešení problémů budou moci používat libovolný programovací jazyk a prostředí (nejčastěji užívanými a preferovanými jsou Perl a C/C++ pod Unixem).
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 18 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Nový předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. Společným tématem semináře pro podzim 2004 je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence". Kurz se bude konat jednou týdně po 2 hodinách, zápočet s 2kr získá každý student, který úspěšně odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolních testech. Dalsi kredit ziskaji studenti za uspesne odprezentovani sveho programu.
- Osnova
- V úvodu budou studenti zasvěceni do základů molekulární biologie potřebných k další práci, jakožto i do specifik práce s biologickými daty, jako jsou biologické sekvence a struktury proteinů. V další fázi studenti relativně samostatně (maximálně ve dvou) nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury dle vlastního výběru. V závěru semináře budou studenti pracovat na vlastních algoritmech a jejich prezentaci ve formě studentské mini-konference (poster a 10-minutova prezentace funkčního programu). V závěru první a druhé části kurzu absolvují studenti krátký kontrolní test.
- Metody hodnocení
- Studenti relativně samostatně (maximálně ve dvou) nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury dle vlastního výběru. V závěru semináře budou studenti pracovat na vlastních algoritmech a jejich prezentaci ve formě studentské mini-konference (poster a 10-minutova prezentace funkčního programu). Po první a druhé části kurzu absolvují studenti krátký kontrolní test.
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
IV105 Seminář z bioinformatiky
Fakulta informatikyjaro 2005
Předmět se v období jaro 2005 nevypisuje.
- Rozsah
- 0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
- Vyučující
- doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)
- Garance
- prof. PhDr. Karel Pala, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky - Předpoklady
- Od zájemců o tento silně mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologických oborů se vyžaduje paralelni navštěvování nebo předcházející absolvování předmětů IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.
- Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
- Mateřské obory/plány
- předmět má 18 mateřských oborů, zobrazit
- Cíle předmětu
- Předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. Společným tématem semináře P pro podzim je "Předpovídání funkce a struktury proteinů ze sekvence". Kurz se bude konat jednou týdně po 1 hodině, kolokvium získá každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.
- Osnova
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).
- Metody hodnocení
- Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání funkce nebo struktury proteinů. Na konci kurzu absolvují studenti krátký kontrolní test. Kolokvium absolvuje každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.
- Navazující předměty
- Informace učitele
- http://www.fi.muni.cz/~lexa/
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
- Statistika zápisu (nejnovější)